QTL定位的原理和方法PPT课件 第三章QTL定位的原理和方法 2021/1/8 2021/1/8 QTL是什么?•数量性状位点(QTL)是影响数量性状的一个染色体片段;•QTL定位是确定数量性状基因在染色体上位置的一种方法;•QTL和QTLs。2021/1/8 为什么要定位它?•它为了解个体数量性状基因之间的行为和交互作用等基础知识...
QTL定位研究与作图(PPT课件)3 1区间作图法(intervalmapping,IM)Lander和Botstein(1989)等提出,建立在个体数量性状观 测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然 法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL进行似然比 检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状 遗传变异只受一...
QTL定位的原理与方法.ppt,Genome wide association using haplotypes * IBD LD mapping * Combined LD-LA mapping Authors investigating the extent of LD in both cattle and sheep were somewhat surprised/alarmed to find not only was LD highly variable across any
(2)区间定位(Interval mapping, Lander & Botstein, 1989): 同时利用两个侧翼标记位点信息,用似然函数方 法分析标记区间内任何一点上具有QTL的概率, 进行似然比(Likelihood ratio)检验。与单标 记分析法比较,该法能大大提高QTL的检测效率, 并能较准确的估计出QTL的位置和效应值。区间 定位已成为目前QTL检测中...
31、)()21 (21)(21 ()21 (21)1 ()1 ()1 ()1 (21mMrdpqardpqrarrqdpdrrpdqdrrpaqarrqaparQTL检测方法检测方法(2)区间定位区间定位(Interval mapping, Lander & Botstein, 1989): 同时利用两个侧翼标记位点信息,用似然函数方法分析同时利用两个侧翼标记位点信息,用似然函数方法分析标记区间内任何一点上具有...
专题一:QTL及其定位方法 QTL的概念QTL检测方法用于QTL定位的群体统计方法图距函数QTL检测所需标记数预估 专题一QTL及其定位方法 QTL的概念 1、AQTLisasegmentofchromosomeaffectingthetrait,notnecessarilyasinglelocus--D.S.Falconeretal,1995 2、Aquantitativetraitloci(QTL)isdefinedasasinglegeneoraclusterofcloselylinked...
To illustrate this, consider the formula that Darvasi and Soller (1997) gave for estimating the 95% CI for QTL location for simple QTL mapping designs under the assumption of a high density genetic map. CI=3000/(kNδ2), where N is the number of individuals genotyped, δ allele ...
•数量性状位点(QTL)是影响数量性状的一个染色体片段;•QTL定位是确定数量性状基因在染色体上位置的一种方法;•QTL和QTLs。19:27 为什么要定位它?•它为了解个体数量性状基因之间的行为和交互作用等基础知识提供了一条路径,允许建立更加真实的表型变异、选择反应和进化过程模型;•将标记信息综合到遗传评估...
(QTL)。利用分子标记进行遗传连锁分析,可以检测出QTL,即QTL定位(QTLmapping)。 借助与QTL连锁的分子标记,就能够在育种中对有关的QTL的遗传动态进行跟踪,从而大 大增强人们对数量性状的遗传操纵能力,提高育种中对数量性状优良基因型选择的准确性和 预见性。因此,QTL定位是一项十分重要的基础研究工作。1988年,Paterson等...
(AIL,Semi-random intercrossing,CI = CIF2 / (t/2,2021/1/30,AIL要保持一定的群体大小; AIL相对于F2使重组近似增加 ,置信区间为: AIL能定位几个QTL或多个QTL到15cM,2021/1/30,Locus-based strategies:Selective phenotyping (SPh,Theoretical basis: Only recombinants increase mapping accuracy for a ...