复合区间作图定位法(Composite Interval Mapping, CIM): 方法:结合区间作图和多元回归特点,在检测某一特定标记区间时,将与其他QTL连锁的标记也拟合在模型中以控制背景遗传效应。 优点:提高了作图的精度和效率,减少了“幻影QTL”现象。 缺点:对相邻标记区间的QTL估计可能引起偏离,当标记密度过大时选择标记的条件因子较难
使用逐步回归,将其它与表型相关的QTL作为协变量控制背景遗传效应。通过引入其他标记作为协变量来消除区间以外QTL对作图区间的影响, 从而消除“幻影”QTL 现象, 适用于同一染色体上有多个QTL 的情形。 4 多区间作图法(Multiple Interval Mapping): 多QTL定位的方法主要有极大似 然法和贝叶斯方法两大类, 极大似然法主要...
> QTL定位技术 接下来,我们将介绍一种常用的QTL定位方法——QTL-seq,该方法特别适用于自然变异下的材料,并能有效地定位主效QTL位点。> QTL分析与株高研究 在图3中,我们聚焦于与水稻植株高度紧密相关的数量性状位点(QTL)研究。若多个QTL共同作用,则不同植株高度的频率分布将趋近于正态分布。为深入探究,我们...
QTL定位方法 第一页,共15页。根据采用的统计分析方法的不同分为:方差与均值分析法、回归及相关分析法、最大似然法等;根据标记区间数分为:零区间作图、单区间作图和多区间作图。将不同方法结合起来的综合分析方法:QTL复合区间作图、多区间作图、多QTL作图、多性状作图 等。第二页,共15页。一、单标记方差分析...
此方法具有以下优点∶1)利用相邻标记的信息,从而可以获得该区间所有位点与QTL的最大连锁信息进而可以完成整个基因组任意位点的测试;2)通过LOD支持区间确定QTL的存在位置;3)检测QTL所需的个体数相对较少;4)若一条染色体上只存在一个QTL,则QTL的定位和估计是比较准确的。此方法可以同时利用两个相邻标记的分离信息,...
QTL定位(QTLmapping)。QTL定位主要有三种方法,单标记分析法,区间定 位分析和复合区间定位分析。单标记分析法就是性状与单标记关联的检测。基 于所采用的统计分析手段的不同,又可分为回归分析、单向分组方差分析、均 值和方差比较等方法(Tanksleyetal.,1982;Weberetal.,1989)。
QTL定位是一种遗传学研究方法,它类似于单基因定位,目的是将遗传上重要的区域(QTL)准确地定位在遗传图谱上。这个过程涉及测量QTL与特定遗传标记之间的距离,这个距离通常以重组率来表示。方法的分类根据使用的标记数量,可以分为单标记、双标记和多标记技术。在统计分析方面,有多种策略。方差与均值分析...
QTL定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL定位在遗传图谱上,确定QTL与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单...
关键位点法是一种基于候选基因的QTL定位方法。该方法通过先验知识或基因功能等因素,选择可能与数量性状相关的候选基因,并通过对这些候选基因进行测定和分析,确定与数量性状相关的基因座。 关键位点法通常需要有关候选基因的信息,比如候选基因的调控途径、表达模式等。通过对候选基因与数量性状之间的关联进行分析,可以确定与...
专题一:QTL及其定位方法 QTL的概念QTL检测方法用于QTL定位的群体统计方法图距函数QTL检测所需标记数预估 QTL的概念 1、AQTLisasegmentofchromosomeaffectingthetrait,notnecessarilyasinglelocus --D.S.Falconeretal,19952、Aquantitativetraitloci(QTL)isdefinedasasinglegeneoraclusterofclosely...