通常，在科学实验中，我们会对所研究的目的基因进行表达分析，常用的方法有实时荧光定量PCR法（qRT-PCR）。有些做RNA-seq的小伙伴，在做完转录组分析之后，一般也都会要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。这里我们讲一下常用的Livak法(2^-∆∆Ct法)是如何计算的，以及在qRT-PCR中常见问题和...
qRT-PCR是特殊的PCR和应该报告基因的结合体,所以qRT-PCR的引物设计要满足一般PCR引物设计的原则,此外还有一些额外的规则。首选扩增子大小为75 - 150bp,但必要时可以使用更长的扩增子(更短的扩增子具有更高的PCR效率)。使用稍长的扩增子(150-200 bp),使我们能够验证分析),40-60% GC含量,Tm接近60°C, 3'端...
② 定量PCR仪在不同位置温度不一样:为获取准确的实验结果,定量PCR仪应定期进行校准。 ③ qRT-PCR预混液未混合均匀:可以轻轻颠倒装有qRT-PCR预混液的离心管来促进混合。注意应避免剧烈摇动或振荡,以免引起气泡的形成。 以上提供的是qRT-PCR相对定量分析的详细步骤以及常见问题和解决方案,希望能对小伙伴们有所...
做完转录组分析之后,一般都要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。荧光定量PCR是一种相对表达定量的方法,他的计算方法有很多,常用的相对定量数据分析方法有双标曲线法,ΔCt法,2^-ΔΔCt法(Livak法),用参照基因的ΔCt法和Pfaffl法。这里主要讲解常用的2^-ΔΔCt法(Livak法)如何计算; qRT-PCR原...
1.qRT-PCR图的定义和用途 定义 qRT-PCR(Real-Time Quantitative Reverse Tranion PCR),即反转录实时定量PCR,结合了PCR与RT-PCR,是一种应用广泛的研究基因表达模式的方法,这种方法主要的优点是范围宽、敏感性高、精确度高,无PCR后处理步骤等。 用途
通常,在科学实验中,我们会对所研究的目的基因进行表达分析,常用的方法有实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)。有些做RNA-seq的小伙伴,在做完转录组分析之后,一般也都会要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。这里我们讲一下常用的Livak法(2^-∆∆Ct法)是如何计算的,以及在qRT-PCR中常见问题和解决方...
通常,在科学实验中,我们会对所研究的目的基因进行表达分析,常用的方法有实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)。有些做RNA-seq的小伙伴,在做完转录组分析之后,一般也都会要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。这里我们讲一下常用的Livak法(2^-∆∆Ct法)是如何计算的,以及在qRT-PCR中常见问题和解决方...
qRT-PCR，全称定量逆转录聚合酶链式反应，其核心原理是通过逆转录酶将RNA模板转化为cDNA（互补DNA），然后通过荧光探针或SYBRGreen等技术进行定量分析。具体过程如下：首先，RNA模板在逆转录酶的协助下，通过特异性引物形成cDNA，确保只转录目标mRNA。接着，荧光染料探针或SYBRGreen等工具参与进来，通过PCR（...
本文将详细介绍qRT-PCR的操作流程。 1. 实验前准备 在进行qRT-PCR实验之前,需要准备以下材料和设备: - RNA样本:提取需要研究的组织或细胞中的总RNA。 - 逆转录试剂盒:包括逆转录酶、随机引物、dNTPs等。 - PCR试剂盒:包括聚合酶、引物、dNTPs等。 - qRT-PCR仪器:包括逆转录仪和实时荧光定量PCR仪。 - 实验...
1、实时定量实时定量PCR (real-time quantitative PCR)目录目录一、实验原理二、实验优点 三、实验缺点四、实验应用五、实验简介 实时定量PCR (real-time quantitative PCR)是指在PCR指数扩增期间通过连续监测荧光信号强弱的变化来即时测定特异性产物的量,并据此推断目的基因的初始量,不需要取出PCR产物进行分离。 评估...