运用计算模板,只需对应输入数据,即可自动计算出公式,结果如下: 1. 数据修正:三个重复,如果CT值差异在0.2以外,则应剔除掉,所得结果均值会更加好。 2. 数据录入:我们在做PCR时候,已经排好版面,所以再挑出这些基因及内参时候,需要花费精力。简单点,可以将结果复制粘贴到新的excle文档,然后“筛选”,依次筛选出不同...
ΔΔCT = ΔCT(test) –ΔCT(calibrator) 最后,计算表达水平比率: 2–ΔΔCT = 表达量的比值 计算模板建立 而现在我们现在用的这款仪器QuantStudio 7 Flex Real-Time PCR System是无法计算的,所以需要自己手动计算,理解原理更容易操作。当然,此公式适合于所有2–ΔΔCT 法的荧光定量。 经我修改后计算模板: ...
脚本只是实现自动化的工具,最主要的还是要理解计算原理,推荐看知乎上的这个非知名研究僧老师发的原理讲解【qRT-PCR相对定量计算详解 - 知乎 (http://zhihu.com)】,对于我这种小白也一看就会。下面简单的重新梳理一遍原理。 PCR产量 = 2^ct * 起始模板量 目的基因起始模板量 = PCR产物量 * 2 ^(-ct) ct 值...
qRT-PCR数据处理模板 Label C(T)Quantity average S(方差)S2(平均方差)样品数据122.61122.436670.170098 样品数据222.4310.173589554样品数据322.271 对照数据119.81119.870.087178 对照数据219.971 对照数据319.831 Water30.671 样品内参基因12.47112.450.034641 样品内参基因12.4110.091833182样品内参基因12.471 对照内参基因11.56111...
计算模板建立 而现在我们现在用的这款仪器QuantStudio 7 Flex Real-Time PCR System是无法计算的,所以需要自己手动计算,理解原理更容易操作。当然,此公式适合于所有2–ΔΔCT 法的荧光定量。 经我修改后计算模板: 网盘下载:Quantitative PCR calculation template for QuantStudio(TM) 7 Flex System_J.F.XIE(均值法...
qRT-PCR数据处理模板 Label样品数据1样品数据2样品数据3对照数据1对照数据2对照数据3Water样品内参基因样品内参基因样品内参基因对照内参基因对照内参基因对照内参基因UBQ10-Water C(T)22.6122.4322.2719.8119.9719.8330.6712.4712.4112.4711.5611.5111.51 Quantityaverage S(方差)S2（平均方差）122.436670....
1）方差分析 根据X的不同，方差分析又可以进行细分。X的个数为一个时，我们称之为单因素方差；X为2...
做完转录组分析之后,一般都要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。荧光定量PCR是一种相对表达定量的方法,他的计算方法有很多,常用的相对定量数据分析方法有双标曲线法,ΔCt法,2^-ΔΔCt法(Livak法),用参照基因的ΔCt法和Pfaffl法。这里主要讲解常用的2^-ΔΔCt法(Livak法)如何计算; ...
有些做RNA-seq的小伙伴，在做完转录组分析之后，一般也都会要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。这里我们讲一下常用的Livak法(2^-∆∆Ct法)是如何计算的，以及在qRT-PCR中常见问题和解决方案。qRT-PCR的原理：以基因的cDNA为模板进行PCR扩增，在PCR扩增过程中，荧光信号的强度与扩增产物的...
PCR数据处理-使用Excel计算Delta Ct -How To Perform The Delta-Delta Ct Method (In Excel) 8569 0 02:11 App ROCHE Light Cycler 96 数据分析 2535 0 06:36 App PCR数据分析及Graghpad绘图 2.0万 14 11:27 App #qPCR系列#相对定量PCR结果计算 1.2万 3 05:34 App CFX-Manager数据分析 12.8万 86 13...