这个数据库还可以查询多个基因的序列,比如: 3. qPrimerDB 最后这个qPrimerDb收录的物种有147个,也就是说如果你做真菌、植物、鱼、昆虫、鸟等物种也可以使用这个数据库,大家可以直接根据转录本编号、物种进行查询,例如ENST00000000233.9: 前面的几个数据库我们就介绍到这里,一般的简单...
具体而言,(i)开发了一种改进的引物设计工具qPrimer,基于之前的qPrimerDB管线,以提高基因组规模qPCR引物设计的效率和简单性;(ii)从1172个生物的1308个基因组中预先计算qPCR引物资源;(iii)引入了一个完整的qPCR引物鉴定、设计、检查、标记和提交系统。qPrimerDB2.0可在https://qprimerdb.biodb.org免费获得。q...
SYBR染料法利用SYBR Green I分子的特点,SYBR Green I 是一种结合于所有双链DNA(dsDNA)双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。SYBR Green I 只有和双链DNA结合后才发荧光,游离的染料分子不发光,在新合成链延伸过程中SYBR Green I掺入双链中,变性时DNA双链解开,SYBR ...
第三步:引物设计 获取完整CDS序列后点击右边Pick Primers 进入该界面,红框中的内容根据设计需求修改,点击页面底部Get Primers获得引物设计结果 得到设计结果后,可根据Tm值、CG含量初步筛选合适的引物,同时注意Self complementarity与Self 3' complementarity越小越好 除了上述方法,小伙伴还可以尝试使用https://biodb...
哈哈,有!小翌根据这个需求找到一款由国内西南大学团队开发的数据库-qPrimerDB。 qPrimerDB 该引物数据库的网络前端提供 1000 多个重要基因组(包括人类、小鼠、斑马鱼、酵母、水芹、水稻、玉米等)的基因特异性和预计算的 qPCR 引物对。qPrimerDB 提供了一个交互式且信息丰富的 Web 图形界面,用于将搜索和 BLAST 结果...
qPrimerDB BLAST是用NCBI-BLAST+构建的比对工具,用于在数据库中比对和搜索同源序列,可以同时选择多个数据库进行比对。由于同一个基因在不同的数据库中有不同的基因ID号,因此qPrimerDB提供了一个BLAST功能,用于将qPrimerDB无法识别的基因ID转化成可以识别的基因ID。 下图红色方框是Blast中的一些常用参数。“Database”...
qPCR原理。 实时荧光定量PCR(qPCR)是一种用于检测DNA或RNA的数量的分子生物学技术。它是基于PCR技术的扩增原理,通过测量DNA或RNA扩增过程中的荧光信号来定量目标分子的数量。qPCR技术在医学诊断、基因表达分析、病原体检测等领域有着广泛的应用。 qPCR的原理基于荧光信号的检测。在PCR扩增过程中,随着DNA或RNA模板的扩增...
DB12/T 1271-2023有机肥中活性大肠杆菌快速测定PMA-qPCR法 美国防腐工程师协会,关于qpcr 样的标准 NACE Paper 14600-2020现场qPCR应用快速微生物检测与量化方法 内蒙古自治区标准,关于qpcr 样的标准 DB15/T 2855-2023马铃薯腐烂茎线虫的qPCR检测技术规程
可借助软件或在线工具进行引物设计。例如,使用NCBI网站查询目标基因序列,然后在Primer Premier 6.0等软件中设置条件进行引物设计。推荐的在线工具包括biodb.swu.edu.cn/qprime和pga.mgh.harvard.edu/pri等,这些工具可根据输入的基因信息自动生成引物设计结果。引物设计的检查与优化:在获取引物设计结果后...
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