clusterProfiler包中的enrichKEGG函数和enrichGO函数的默认p值校正方法为BH法 qvalue enrichKEGG函数和enrichGO函数都包含一个用于富集的函数enricher_internal(这个函数属于R包DOSE),而在enricher_internal里,qvalue是用R包qvalue里的qvalue函数算的,用的是bootstrap方法,bootstrap方法是Storey提出的,所以大概算是Storey...
我们在生物数据统计分析中,经常会听到p-value,adjusted p-value,q-value以及False discovery rate(FDR)。比如最常见实验组和对照组的差异基因表达分析,除了获得一个p值(p-value),通常而言还会得到一个adjusted p-value或者FDR(false discovery rate)。那么他们之间到底有什么关系,为什么已经有了一个p-value来指征显...
这是我们最常用的校正P-value控制假阳性率的方式。假设针对10000个基因进行了统计检验,对所有的原始P-value进行由小到大的排序分别为p1, p2, ..., p10000,校正后的FDR为:p1*10000/1, p2*10000/2, ..., p10000*10000/10000。与Bonferroni correction一致的地方是都乘以了检测总数,不一致的地方是BH算法在此...
生物数据统计分析中，p-value、adjusted p-value、q-value和False Discovery Rate (FDR) 是几个关键的概念，它们在判断实验组与对照组差异显著性时起着重要作用。虽然p-value直观地表示在假设H0（不存在差异）为真时，观察到数据的概率，但它可能受到多重假设检验的影响，导致假阳性结果。为了解决这个问...
在统计分析中，p-value、p-adjust和q-value是三个关键概念，它们在检验假设和控制错误率中扮演重要角色。p-value是一个在假设检验中使用的统计量，它衡量在原假设（H0）成立的前提下，观察到特定结果的概率。当p值小于预先设定的阈值（如0.05），这暗示观察结果可能不支持H0，倾向于接受备选假设（H1...
⼀⽂了解P-value，多重⽐较，FDR和Qvalue的差别 ⾸先交代⼀下⽤来说明这⼏个统计量的例⼦。这⾥会使⽤基因表达作为⼀个例⼦。假设我们有两组细胞：对照组和处理组。我们正在研究基因 A 在处理的条件下是否受到表达或没有表达。每组我们有 12 个重复。我们通常做的是取每组 12 个重复的平均...
pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value...
写出下列有机物的结构简式或进行系统命名(1)2,6-二甲基-4-乙基辛烷:___地随流鸡末记斤吧导稳较___;(2)2,5-二甲基-2-己烯 (r)助独服只果态座紧书-2-溴丁烷结构式 1-来自己烯和己烯-1区别 丙炔来自如何合成2-己烯 与方差分析中P-value和F-crit是什么相关的问答 PVA105、PVA205和PVA224的型号...
p-value就是算出这个统计量所代表的在原假设为真的前提下的一个指标，根据小概率事件原则，这个指标不...
∴p+q=m+n+mn=3+2=5. 故答案为:5. 点评:本题考查了根与系数的关系,属于基础题,关键是掌握x1,x2是方程x2+px+q=0的两根时,x1+x2=-p,x1x2=q,然后再根据已知条件正确进行求解. 练习册系列答案 单元智测卷系列答案 课课练小学英语AB卷系列答案 ...