传统方法只能顺利处理小型矩阵,遇到大矩阵时,networkx.to_numpy_matrix()会报内存溢出的错误。解决办法是不用两步转换,而是用networkx.to_scipy_sparse_matrix()方法直接从图存储为邻接矩阵的稀疏矩阵格式。代码如下: # 导入包 import scipy.sparse as sp import pandas as pd impor
distance=nx.dijkstra_path_length(G, source='H', target='F')print('节点H到F的距离为:', distance)#一点到所有点的最短路p=nx.shortest_path(G,source='H')#target not specifiedd=nx.shortest_path_length(G,source='H')fornodeinG.nodes():print("H 到",node,"的最短路径为:",p[node])pri...
def visualize_adjacency_matrix(adjacency_matrix): G = nx.from_numpy_matrix(adjacency_matrix) pos = nx.spring_layout(G) # 定义节点位置 nx.draw(G, pos, with_labels=True, node_color='skyblue', node_size=500, font_size=10) # 绘制图 edge_labels = {(i, j): w['weight'] for i, j...
在上面的代码中,我们首先导入了 Networkx 库,然后使用nx.from_numpy_matrix(A)函数从邻接矩阵 A 中加载图 G。我们还可以使用nx.adjacency_matrix(G)函数获取图 G 的邻接矩阵。 我们可以使用nx.draw函数来绘制图 G。在这个函数中,我们可以设置节点的大小、颜色、透明度等参数。我们还可以使用nx.draw_networkx_node...
to_numpy_matrix(mol)) # 打印邻接矩阵信息 elements = nx.get_node_attributes(mol, name = "element") nx.draw(mol, with_labels=True, labels=elements) plt.savefig('pysmiles.png') # 保存图层 上述是一个简单的SMILES表达式读取的程序,执行的结果如下所示: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 ...
to_numpy_matrix(mol)) # 打印邻接矩阵信息 elements = nx.get_node_attributes(mol, name = "element") nx.draw(mol, with_labels=True, labels=elements) plt.savefig('pysmiles.png') # 保存图层 上述是一个简单的SMILES表达式读取的程序,执行的结果如下所示: dechin@ubuntu2004:~/projects/gitlab/de...
\boldsymbol{v} = \begin{bmatrix} v_1 \\ v_2 \\ \vdots \\ v_n \end{bmatrix}, \quad k \cdot \boldsymbol{v} = \begin{bmatrix} k \cdot v_1 \\ k \cdot v_2 \\ \vdots \\ k \cdot v_n \end{bmatrix} \tag{4}我们可以用 NumPy 的数组来表示向量,向量的加法可以通过两个...
G=nx.random_graphs.erdos_renyi_graph(,0.5)draw_graph(G)W=nx.adjacency_matrix(G)print(W.todense()) 当我们构建好邻接矩阵,我们就可以开始构造度矩阵。对于度矩阵的每一行,我们通过对邻接矩阵中相应行的所有元素求和来表示度矩阵的对角线。然后,我们通过从度矩阵中减去邻接矩阵来计算拉普拉斯矩阵。计算代码和...
# Function to print permutations of string # This function takes three parameters: # 1. String # 2. Starting index of the string # 3. Ending index of the string. defpermute(a, l, r): ifl==r: printtoString(a) else: foriinxrange(l,r+1): ...
import numpy as npimport networkx as nximport matplotlib.pyplot as plt# 创建数据ind1 = [5, 10, 3, 4, 8, 10, 12, 1, 9, 4]ind5 = [1, 1, 13, 4, 18, 5, 2, 11, 3, 8]df = pd.DataFrame({'A': ind1, 'B': ind1 + np.random.randint(10, size=(10)), 'C': ind1...