importnibabelasnib# 读取 NII 文件nii_file_path='path/to/your/file.nii'nii_img=nib.load(nii_file_path)# 获取影像数据data_array=nii_img.get_fdata()# 获取 NII 文件的一些基本信息affine_matrix=nii_img.affine header_info=nii_img.headerprint("影像数据形状:",data_array.shape)print("仿射矩阵:...
我们首先需要加载NII文件。使用nibabel库可以方便地加载NII文件。以下是加载NII文件的示例代码: AI检测代码解析 importnibabelasnib# 加载NII文件nii_file=nib.load('path/to/your/nii/file.nii.gz')# 获取三维数据data=nii_file.get_fdata() 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 以上代码中,我们使用nib.load()函数...
import nibabel as nib import numpy as np import time # 读取nifti文件 starttime = time.time() nii_path = 'd:/test.nii' nii_img = nib.load(nii_path) # 获取原始数据和头部信息 data = nii_img.get_fdata() header = nii_img.header # 输出标签为1的文件 label_1_data = np.zeros_like(...
在Python中,读取NIfTI(.nii)文件通常使用nibabel或SimpleITK库。以下是使用这两个库读取NIfTI文件的步骤和示例代码: 使用nibabel 库读取 NIfTI 文件 导入所需库: python import nibabel as nib 读取NIfTI 文件: python nii_file = 'path_to_your_nii_file.nii' img = nib.load(nii_file) 获取并处理数据...
使用Python的nibabel库可以实现对nii.gz图像的导入，nibabel库专门用于处理神经影像学数据格式，支持多种格式的医学图像数据读取与写入，包括nii.gz格式。导入nii.gz图像的示例代码如下：首先通过nib.load()函数读取图像数据，返回一个Nifti1Image对象。接着使用get_fdata()函数获取图像数据，返回一个NumPy...
在示例代码中，首先使用nib.load()函数读取 nii.gz 图像数据，返回的是一个Nifti1Image对象。接着使用...
python处理nii文件 第一步安装nibabel,可以使用命令:pipinstall nibabel 之后: from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D as osd import nibabel as nib filename = 'image.nii' img = nib.load(filename) #输出文件信息 print(img) w,h,q = img.dataobj.shape...
import nibabel as nib from nibabel import nifti1 from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D example_filename = '../ADNI_nii/ADNI_002_S_0413_MR_MPR___N3__Scaled_2_Br_20081001114937668_S14782_I118675.nii' img = nib.load(example_filename)print (img)print (img.header['db_name']) #输出...
import nibabel as nibimport numpy as npimport skimage.measureimport torch# 路径nii_data ="skull_complete.nii.gz"img = nib.load(nii_data)voxel = torch.tensor(np.array(img.dataobj,dtype=np.float32)).unsqueeze(0).unsqueeze(0)voxel = torch.nn.functional.inter...
nii_file=nib.load('example.nii') 1. 读取NII文件后,我们可以通过get_fdata()方法获取图像数据。这将返回一个NumPy数组,其中包含图像的像素值。 AI检测代码解析 image_data=nii_file.get_fdata() 1. 现在,我们已经成功地将NII文件读入了Python中,并将图像数据保存在image_data变量中。