Pymol安装Caver3报错 技术标签: 生物信息 pycharm tensorflow pythonPlugin“Caver3”has been installed but initialization failed /Unable to initialize plugin ‘Caver3’ (pmg_tk.startup.Caver3). 解决: PyMOL>import pmg_tk.startup.Caver3 Traceback (most recent call last): File "D:\ProgramData\...
1. CAVER Plugin 🔍 功能:CAVER 插件是探索蛋白质分子内部通道和孔道的强大工具。这些通道是配体、离子或水分子在蛋白质中移动的路径。通过 CAVER,用户可以直观地分析这些通道的几何形状、位置和动态变化,从而深入了解分子内部的相互作用。 2. Align (SuperPose/align) Plugin 🆔 功能:Align 插件是 PyMOL 中用于...
在PyMOL命令行中输入以下命令来启动CaverPyMol并进行分析: run /path/to/caver_pymol_plugin.py caver protein.pdb 这些命令将启动CaverPyMol,并加载你要分析的蛋白质结构文件(protein.pdb)。 🌈 示例分析 以下是一个使用CaverPyMol插件进行通道分析的示例: run /path/to/caver_pymol_plugin.py fetch 1HVR ...
12.Pymol基础操作(5)b-factor-value绘制及分析 09:33 13.Pymol基础操作(6)蛋白结构比较分析 10:11 14.Pymol基础操作(7)蛋白通道分析插件CAVER的安装 10:47 15.Pymol基础操作(8)蛋白通道分析 10:34 16.Pymol基础操作(9)单点饱和突变 10:48 17.Pymol基础操作(10)绘制蛋白截面 10:36 2...
14.Pymol基础操作(7)蛋白通道分析插件CAVER的安装 10:47 15.Pymol基础操作(8)蛋白通道分析 10:34 16.Pymol基础操作(9)单点饱和突变 10:48 17.Pymol基础操作(10)绘制蛋白截面 10:36 14.Pymol基础操作(7)蛋白通道分析插件CAVER的安装 中科科翼 1128 0 ...
The APBS plugin [3] is an interface to the popularadaptive Poisson-Boltzmann solver (APBS [4]) programand provides easy access to electrostatics calculations andthe visualization of potential energy surfaces and chargedensities on protein surfaces. CAVER [5, 6] performscalculations of substrate ...
14 changes: 10 additions & 4 deletions 14 plugins/Caver2_1_2.py Original file line numberDiff line numberDiff line change @@ -10,13 +10,16 @@ from __future__ import division from __future__ import generators import os, math, platform import os import math import platform import...
12.Pymol基础操作(5)b-factor-value绘制及分析 09:33 13.Pymol基础操作(6)蛋白结构比较分析 10:11 14.Pymol基础操作(7)蛋白通道分析插件CAVER的安装 10:47 15.Pymol基础操作(8)蛋白通道分析 10:34 16.Pymol基础操作(9)单点饱和突变 10:48 17.Pymol基础操作(10)绘制蛋白截面 10:36 Py...
14.Pymol基础操作(7)蛋白通道分析插件CAVER的安装 中科科翼 932 0 13:33 2.PyMol视频教程-界面简介及基本操作 中科科翼 1559 0 11:18 5.PyMol视频教程-使用pymol导出论文发表级高质量图片 中科科翼 6227 1 12:16 3.PyMol视频教程-使用pymol制作蛋白surface图 中科科翼 2561 0 ...
14.Pymol基础操作(7)蛋白通道分析插件CAVER的安装 中科科翼 932 0 2.PyMol视频教程-界面简介及基本操作 中科科翼 1559 0 5.PyMol视频教程-使用pymol导出论文发表级高质量图片 中科科翼 6227 1 3.PyMol视频教程-使用pymol制作蛋白surface图 中科科翼 2561 0 ...