为了使用稀疏矩阵乘法,MessagePassing框架需要新增一个message_and_aggregate()方法,该方法将message()方法和aggregate()方法融合进了一个计算步中,在其接受到SparceTensor类的时候被调用。基于此,GINConv层可以重写成: rom torch_sparse import matmul class GINConv(MessagePassing): def __init__(self): super()...
MessagePassing基类的构造函数中初始化了一个非常重要的类Inspector,这个类实现了对子类中自定义的message,aggregate,message_and_aggregate,以及update函数的入参提取。 self.inspector=Inspector(self)self.inspector.inspect(self.message)self.inspector.inspect(self.aggregate,pop_first=True)self.inspector.inspect(self....
但是实际上aggregate、update里的参数可以不仅是message里的参数 查看message_passing.py源码后可以发现,每次执行函数之前都会通过inspector.py的distribute函数来寻找参数。 根据源码可知,如果edge_index是SparseTensor类型,就会把message和aggregate结合为一个函数message_and_aggregate 自定义message,输入是(propagate多传的参数...
如果message_and_aggregate实现了, 则调用它, 否则向下执行; out = self.message(**msg_kwargs); out = self.aggregate(out, **aggr_kwargs); out = self.update(out, **update_kwargs); 然后输出 message部分默认接受xjxj, 默认情况下, python ...
然后,我们继续调用propagate(),它在内部调用message()、 aggregate()和update()函数。作为消息传播的附加参数,我们传递节点嵌入和规范化系数 。 在message()函数中,我们需要通过规范化相邻节点特征。这里,表示提升的张量,它包含每个边的源节点特征,即每个节点的邻居。节点功能可以通过追加或附加到变量名称来自动解除。事...
message为公式中 ϕ \phi ϕ 部分 aggregate为公式中 □ \square □ 部分 update为公式中 γ \gamma γ 部分 MessagePassing Class PyG使用MessagePassing类作为实现 信息传递 机制的基类。我们只需要继承其即可。 GCN demo GCN信息传递公式如下: x i k = ∑ j ∈ i ∪ { i } 1 d e g ( i ) ...
而消息传递,聚合,更新则是通过修改messagepassing父类中的message,aggregate 以及子类中的forward来实现的...
1、首选 DGL 框架,因为这个框架很具有前瞻性,message-passing 的实现很先进。2、PyG 适合刚入门,上手...
def message_and_aggregate(self, adj_t: SparseTensor, x: Tensor) -> Tensor: return matmul(adj_t, x, reduce=self.aggr) return spmm(adj_t, x, reduce=self.aggr) def __repr__(self) -> str: return (f'{self.__class__.__name__}({self.in_channels}, '5...
Added support for EdgeIndex in message_and_aggregate (#9131) Added CornellTemporalHyperGraphDataset (#9090) Added support for cuGraph data loading and GAT in single node Papers100m examples (#8173) Added the VariancePreservingAggregation (VPA) (#9075) Added option to pass custom from_smiles funct...