5.lnc-POP1-1促进DNA修复过程并与MCM5结合 为了深入研究lnc-POP1-1影响HNSCC细胞顺铂耐药性的机制,研究者使用RNA pull-down和蛋白质谱分析(LC-MS/MS)来探索推定的与lnc-POP1-1相互作用的RNA结合蛋白。顺铂耐药的HN4/DDP和HN30/DDP细胞表现出比顺铂敏感的HN4和HN30细胞更低的γH2AX(一种DNA损伤标记物)表...
Pull Down Mass Spectrometry常用的质谱技术主要是液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)。Pull Down Mass Spectrometry是一种用于分析蛋白质相互作用的技术。这种方法通过“Pull Down”实验,结合质谱技术,可以准确的鉴定和定量蛋白质相互作用。 在Pull Down实验中,目标蛋白质会先与特异性的结合蛋白质或小分子联结,然后再通过一系...
5.lnc-POP1-1促进DNA修复过程并与MCM5结合 为了深入研究lnc-POP1-1影响HNSCC细胞顺铂耐药性的机制,研究者使用RNA pull-down和蛋白质谱分析(LC-MS/MS)来探索推定的与lnc-POP1-1相互作用的RNA结合蛋白。顺铂耐药的HN4/DDP和HN30/DDP细胞表现出比顺铂敏感的HN4和HN30细胞更低的γH2AX(一种DNA损伤标记物)表达。
GST Pull-down实验用于研究蛋白之间的直接或间接相互作用,此外还可以结合色谱串联质谱(LC-MS/MS)筛选已知蛋白的未知互作蛋白。由于实验时需要将蛋白在体外纯化出来,因此这种方法属于体外研究蛋白互作的方法。实验原理 GST Pull-down实验的基本原理是将靶蛋白-GST融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲...
RNA pull down 检测 :RNA沉淀检测,是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。使用体外转录将RNA进行生物素标记,并与细胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白复合物。复合物通过磁珠结合后分离,复合物纯化洗脱后通过Western blot验证检测特性的蛋白。若筛选可能结合的蛋白通过质谱实验进行检测筛选。
样品处理—GST/His-诱饵蛋白原核表达载体构建—GST融合蛋白表达—GST融合蛋白纯化—Pull-down捕获猎物蛋白—SDS-PAGE电泳—Western blot或LC-MS/MS 二、DNA Pull-down DNA pull-down是一种新颖的体外研究DNA与蛋白互作的实验技术。该技术以研究的DNA序列为探针,寻找与该序列结合的蛋白质,最常见的应用是寻找某个或者...
样品处理—GST/His-诱饵蛋白原核表达载体构建—GST融合蛋白表达—GST融合蛋白纯化—Pull-down捕获猎物蛋白—SDS-PAGE电泳—Western blot或LC-MS/MS 二、DNA Pull-down DNA pull-down是一种新颖的体外研究DNA与蛋白互作的实验技术。该技术以研究的DNA序列为探针,寻找与该序列结合的蛋白质,最常见的应用是寻找某个或者...
同时,Pull-down也可以对Co-IP实验鉴定到的蛋白相互作用关系做进一步验证。若将Co-IP/Pull-down技术与以LC-MS为基础的蛋白质组学技术结合,通过一次实验便能高通量的鉴定和筛选到多个与待研究的目的蛋白存在相互作用的蛋白质(蛋白质复合物组分)。百泰派克生物科技基于专业的技术团队以及丰富的服务经验为广大科研人员...
20K做小分子靶点筛选比 pulldown+MS 的优势? 分类:小分子药物靶点FAQ 作者:华盈生物 来源:【概要描述】 1)芯片实验为体外实验,芯片上每个蛋白点相互独立,保证筛选到的互作蛋白 均为目标蛋白的直接结合蛋白,数据分析简单;pull down-LC/MS 检测到的是与小分子有结合的蛋白复合物,不一定是直接结合的蛋白。 2)...
图1 GST Pull-down验证蛋白互作原理图。 操作步骤: 样品处理—GST/His-诱饵蛋白原核表达载体构建—GST融合蛋白表达—GST融合蛋白纯化—Pull-down捕获猎物蛋白—SDS-PAGE电泳—Western blot或LC-MS/MS 二、DNA Pull-down DNA pull-down是一种新颖的体外研究DNA与蛋白互作的实验技术。该技术以研究的DNA序列为探针,寻...