smiles:化合物的SMILES表示法。 inchi:化合物的InChI表示法。 formula:化合物的分子式。 cid:化合物的PubChem化合物标识符。 inchikey:化合物的InChI Key。 例如,如果要通过名称搜索化合物,可以使用以下代码: 例如,如果要通过名称搜索化合物,可以使用以下代码: ...
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PubChemPy提供了一种Python与PubChem进行交互的方法。 允许按名称、子结构和相似性进行化学搜索、化学标准化、化学文件格式之间的转换、化学性质的描述和检索。 PubChemPy功能 通过名称,SMILES,InChI和SDF搜索PubChem物质和化合物数据库。 检索给定输入结构的标准化化合物记录。 在SDF,SMILES,InChI,PubChem CID等之间转...
PubChemPy提供了一种Python与PubChem进行交互的方法。 允许按名称、子结构和相似性进行化学搜索、化学标准化、化学文件格式之间的转换、化学性质的描述和检索。 PubChemPy功能 通过名称,SMILES,InChI和SDF搜索PubChem物质和化合物数据库。 检索给定输入结构的标准化化合物记录。 在SDF,SMILES,InChI,PubChem CID等之间转...
properties = compound.to_dict(properties=['atom_stereo_count', 'bonds', 'isomeric_smiles', 'xlogp', 'exact_mass']) ``` 这将返回一个包含所查询的化合物的化学性质的字典。 6.获取相关化合物:通过使用相似性查询,pubchempy库还允许你根据一个化合物获取与之相似的化合物信息。例如,你可以使用以下命令...
>> > comp = Compound . from_cid ( 1423 ) >> > print ( comp . isomeric_smiles ) CCCCCCCNC1CCCC1CCCCCCC ( = O ) O >> > comps = get_compounds ( Aspirin , name ) >> > print ( comps [ 0 ]. xlogp ) 1.2 安装 使用以下命令安装PubChemPy: pip install pubchempy 或者,尝试其点...
>>>frompubchempyimportget_compounds,Compound>>>comp=Compound.from_cid(1423)>>>print(comp.isomeric_smiles)CCCCCCCNC1CCCC1CCCCCCC(=O)O>>>comps=get_compounds('Aspirin','name')>>>print(comps[0].xlogp)1.2 Installation Install PubChemPy using: ...
通过名称,SMILES,InChI和SDF搜索PubChem物质和化合物数据库。 检索给定输入结构的标准化化合物记录。 在SDF,SMILES,InChI,PubChem CID等之间转换。 检索计算的属性,指纹和描述符。 生成2D和3D坐标。 获取给定化合物的IUPAC系统名称,商品名称和所有已知的同义词。
print(compound.isomeric_smiles) print(compound.iupac_name) ``` 输出结果: **2.输出为excel ```c from pubchempy import get_compounds, Compound for compound in get_compounds('Myriocin-12-en', 'name'): b1 = compound.cid c1 = compound.isomeric_smiles ...