接下来的步骤包括使用PubChem数据库批量获取化合物的CID(化合物识别号),从而筛选出与目标基因相关的候选化合物,并通过批量分子对接实验进一步评估它们作为潜在治疗策略的有效性。 CTD数据库药物筛选及下载 请下载.csv文件 http://ctdbase.org CTD_4234_ixns_20240203242441.csv PubChem批量检索CID:简化您的化学数据查询...
点击‘best match’下的第一条数据，详情页中有aspirin信息概览，包括PubChem CID、化合物结构、化学安全分类、分子式、同义词、分子量和数据更新时间，并提供aspirin药理功能注释和肝毒性信息，提供NCI Thesaurus、LiverTox和DrugBank数据库链接。右侧栏为该页面所展示的信息目录。接下来对主要的子目录做一个简单的说明：...
根据个人需求挑选合适的API接口，并输入相应的查询参数，例如化合物CID、物质ID等。发起HTTP请求，获取返回的JSON或XML格式数据，并将其保存在本地。此方法适用于科研团队，特别是那些需要动态访问数据、进行自动化查询或编程调用数据的团队，尤其适用于大型数据分析或机器学习项目。五、PubChem的实际应用 由于PubChem数据...
Retrieve compound information from pubchem CID
点击‘best match’下的第一条数据,详情页中有aspirin信息概览,包括PubChem CID、化合物结构、化学安全分类、分子式、同义词、分子量和数据更新时间,并提供aspirin药理功能注释和肝毒性信息,提供NCI Thesaurus、LiverTox和DrugBank数据库链接。右侧栏为该页面所展示的信息目录。
Pubchem CID HMDB ID SMILES InChI InChIKey 01 CAS Registry Number CAS Registry Number是我们向供应商采购代谢物的关键依据(以保障买到正确的代谢物)。CAS Registry Numberd的本质是代谢物到美国化学学会CAS注册数据库注册获得的注册号。 CAS Registry Number的格式为“[0-9]{2-7}-[0-9]{2}-[0-9]”,第...
pythonwith open('cids.txt') as f: cids =[line.strip() for line in f]for cid in cids: compound = pcp.Compound.from_cid(cid) print(compound.iupac_name, compound.molecular_weight)8.结论 使用PubChem REST API创建爬虫是一项非常有用的技能，可以帮助化学研究人员快速、高效地收集所需数...
(3)CID :化合物在 PubChem 数据库中的唯一标识符 (Compound ID)。 (4)MF :化合物的分子式(Molecular Formula)。 (5)SMILES :化合物的 SMILES 表示法(用于描述分子结构的线性字符串表示)。 (6)MW :化合物的分子量(Molecular Weight)。 (7)InChIKey :化合物的标准化 InChIKey(唯一标识化学结构的哈希键)...
原料中文名称 UBP32, PUBCHEM CID: 642161 中文别名 (S)-1-(2-AMINO-2-CARBOXYETHYL)-3-(2-CARBOXYBENZYL)PYRIMIDINE-2,4-DIONE;UBP 302;(αS)-α-amino-3-[(2-carboxyphenyl)methyl]-3,4-dihydro-2,4-dioxo-1(2H)-pyrimidinepropanoic acid;2-[[3-[(2S)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxopy...
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