PubChem提供了丰富的API接口,允许用户通过编程方式访问和下载数据。API文档地址为:https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/docs/pug-rest。用户可以根据需要选择适当的API进行操作。根据个人需求挑选合适的API接口,并输入相应的查询参数,例如化合物CID、物质ID等。发起HTTP请求,获取返回的JSON或XML格式数据,并将其保存...
PubChem PUG REST中化合物的识别号有三种类型:SID表示物质、CID表示化合物,AID表示实验。 访问API并获取数据,主要通过构建URL来实现,举个例子,通过SMILES表示的化学结构作为输入。它还支持将化学结构以PNG格式的图像输出。你可以将这两者结合起来,形成一个可视化请求,用于显示一个特定的SMILES字符串对应的化学物质是否在...
该 API 允许基于 PubChem CID 检索各种类型的信息,包括化合物属性、相互作用和路径数据。可以使用此 API ( volkamerlab.github.io)自动化并处理大量数据。但是尝试API接口之后只能获取到一些静态的信息,像下图中的信息是通过动态加载得到的,API接口无法得到,只好进行爬虫了。 添加图片注释,不超过 140 字(可选)以下...
PubChem PUG-REST API :可以使用 PubChem PUG-REST API 通过 SMILES 字符串或CID等直接查询 PubChem 数据库。该 API 允许基于 PubChem CID 检索各种类型的信息,包括化合物属性、相互作用和路径数据。可以使用此 API ( volkamerlab.github.io)自动化并处理大量数据。 但是尝试API接口之后只能获取到一些静态的信息...
该 API 允许基于 PubChem CID 检索各种类型的信息,包括化合物属性、相互作用和路径数据。可以使用此 API ( volkamerlab.github.io)自动化并处理大量数据。但是尝试API接口之后只能获取到一些静态的信息,像下图中的信息是通过动态加载得到的,API接口无法得到,只好进行爬虫了。 添加图片注释,不超过 140 字(可选)以下...
我们将使用Python和PubChem REST API来创建我们的爬虫。我们需要安装pubchempy库,它是一个用于访问PubChem数据库的Python接口。pythonimport pubchempy as pcp#搜索化合物compounds = pcp.get_compounds('aspirin','name')#获取化合物属性for compound in compounds: print(compound.iupac_name) print(compound...
利用药物名称批量查询并返回SMILES分子式,实现高效分子数据检索。此外,PUG REST服务支持返回更详细的批量结果和更多内容,为用户提供丰富信息。对于PubChem API的深入探索和具体应用,还需结合实际项目需求和API文档,灵活运用PUG REST提供的功能,以满足不同场景下的化学数据访问和利用需求。
PubChemPy是一个基于PubChem REST API的简化接口,可用于访问PubChem数据库。它提供了许多功能,如搜索化合物、获取化合物的属性和描述符、下载化合物的结构图等。PubChem是一个免费的公共数据库,包含大量的化合物信息,对于进行化学研究和药物开发非常有用。
1. PubChem简介 PubChem是美国国立医学图书馆(NLM)开发和维护的免费化学信息资源库,其中包含有关分子结构、属性、生物活性等方面的信息。同时,它还提供了多种检索工具和API接口,便于用户访问和使用。因此,将其作为化学信息资源库是非常合适的。2.爬虫原理介绍 爬虫是一种自动化程序,可以模拟人类在网络上浏览、...
PubChemPy是一个基于PubChem REST API的简化接口,可用于访问PubChem数据库。它提供了许多功能,如搜索化合物、获取化合物的属性和描述符、下载化合物的结构图等。PubChem是一个免费的公共数据库,包含大量的化合物信息,对于进行化学研究和药物开发非常有用。