PSIPRED是由英国David T. Jones实验室开发的一款高效蛋白质二级结构预测工具,广泛应用于生物学研究、药物开发和蛋白质工程等
二级结构预测工具 psipred 可以提供以下几种蛋白质二级结构的预测 :A.Alpha- 螺旋B.beta- 折叠C.无规则 卷曲D.茎 环结构搜索 题目 二级结构预测工具 psipred 可以提供以下几种蛋白质二级结构的预测 : A.Alpha- 螺旋B.beta- 折叠C.无规则 卷曲D.茎 环结构 答案 ABC 解析...
tar -zxvf psipred3.5.tar.gzcdpsipred/src make make install 实际上,在进行编译和安装之前,在psipred/bin下已经存在所有所需的命令,但我还是按照README中文档进行的编译并安装,但是当你在安装时,可以尝试不编译安装是否有何影响. 环境变量 系统环境变量设置 exportBLAST_HOME=/home/yizhou/blast-2.2.26exportPSIB...
从PSIPRED V4.0开始,我们不再认为有必要对与PSI-BLAST一起使用的序列数据库进行过滤以除去低复杂度区域,跨膜区域和卷曲螺旋片段。 因此,搜索数据库可以是任何大型的非冗余蛋白质序列数据库,建议使用UNIREF90(http://www.uniprot.org/help/uniref)。 参考资料 http://bioinfadmin.cs.ucl.ac.uk/downloads/psipred/...
PSIPRED是用于蛋白质二级结构预测的软件。 A.对 B.错 点击查看答案&解析 你可能感兴趣的试题 单项选择题连续釜式反应器操作中存在着火点和熄火点问题,无论是着火点还是熄火点,均是由于釜式反应器中存在的 A、多定态问题 B、稳定的定态点问题 C、多定态问题和稳定的定态点问题 D、不清楚 点击查看答案&解析...
网络预测服务器中 网络释义 1. 预测服务器中 5 TMHMM result of possible transmembrane helices for PLRV·CP proteins 构预测服务器中(PSIPRED),对其进行二级结构 … www.docin.com|基于 1 个网页
PSIPRED能够预测α-螺旋、β-折叠和无规卷曲这三种主要的二级结构类型，并提供相应的概率值。网址：http:...
every other secondary structure prediction method, PSIPRED does not perform as on single sequences. Any secondary structure prediction based on a single sequence should be considered as unreliable. running PSIPRED, please check the runpsipred and runpsipred_single scripts to see if the path...
PSIPRED-powerpoint ProteinSecondaryStructurePredictionBasedonPosition-specificScoringMatrices 基于位置特异性评分矩阵的蛋白质二级结构的预测 概念 PHD：基于序列相似性准则?、通过严格的盲测试实验、使用二阶神经网络预测PSIBLAST生成的评分矩阵的蛋白质的二级结构、基于CASP3实验PSIPRED：187个特殊折叠的新测试集、基于结构...
由于psipred运行错误导致预测二级结构出现错误,也不能继续向下执行。 解决方法如下: 1. 首先到github下载psipred源码(https://github.com/psipred/psipred): 1git clone https://github.com/psipred/psipred2cd psipred 2. 进入src目录后,修改sspred_avpred.c文件第241行,buff size 由256修改到512: ...