利用贝叶斯天际线聚结模型揭示了 PRRSV-2 亚谱系之间存在有效种群规模的差异,充分展现了不同种群在不同时间的相对遗传多样性的波动模式。 病毒的重组事件推动了 PRRSV-2 广泛的多样性,该研究利用 RDP5 、Simplot 和 VirusRecom 程序的综合输出,共鉴定了 273 个独特的重组事件,进一步分析阐明了自然循环下的中国 PRRS...
PRRSV的分类方法主要有2种,RFLP分析(限制性片段长度多态性)和lineage(谱系)划分,其中RFLP对PRRSV ORF5的分析最早可追溯到1998年,当时主要是用来区分野毒与疫苗毒Ingelvac PRRS MLV vaccine (RFLP 2-5-2),而后该方法主要在北美地区使用;谱系划分最经典的参考文献是2010年Shi Mang等对全球8624条ORF5序列的分析,...
中国和美国北美型PRRSV的基因组序列进行了比较，研究结果发现，该病毒在中国和美国的传播存在明显差异。中国PRRSV主要分布在L8和L1两个谱系，其中L8系列占比达到53%，并且在一些省份发现了多系共存的情况。而美国北美型PRRSV主要分布在L1和L2两个谱系，且在各州的分布比例相对均衡。同时，研究团队还对PRRSV的重组和NSP...
属于 PRRSV-2 谱系 1 的类 NADC30 毒株(包括与谱系 8 毒株的重组病毒)占 47.62% ;属于 PRRSV-2 谱系 1 的类 NADC34毒株占 0.71% ;属于 PRRSV-2 谱系5 的毒株( 类 VR-2332 疫苗毒株 )占 45.24% ;未检测到 PRRSV-1 毒株。
PRRSV-2:包含9个谱系( L1-L9)。 ①L1分支流行比较广,分为L1A-1H(L1.1-L1.9),包含两大类:以NSP2 100个氨基酸缺失的L1A分支,以NSP2 131个氨基酸缺失的L1B-L1H分支。 ② L1分支在世界上多个国家流行,北美、南美、中美、亚洲,和中国密切相关的为L1A(L1.5,类NADC34)和L1C(L1.8,类NZADC30)。
根据ORF5区域的系统发育关系，基于系统发育谱系的PRRSV分型方法：PRRSV-1毒株分四个亚型，亚型I（全球）、亚型I（俄罗斯）、亚型II和III）；PRRSV-2毒株分为九个分支（L1-L9）。目前广泛流行的主要是PRRSV-2，具有高度的遗传多样性，9个分支可以进一步划分为几个亚分支。其中PRRSV-2的L1分支在美国和亚洲养猪业中...
Swine Vet Share | 张振东:生产上非瘟基因分型的意义有多大? MicrobiolSpectr| PRRSV2毒株分类新进展(ORF5的谱系划分) Transbound Emerg Dis | 非洲猪瘟病毒污染的环境不能使哨兵猪发病? Swine Vet Share | 平原地区非瘟防控建议及前置功能区生物安全评估调查 ...
PRRSV的1-7-4谱系最初于2016年在美国报道,至少在五个州出现了母猪流产风暴和仔猪高死亡率。此后,PRRSV的这一亚型被证实在秘鲁流行。中国首个1-7-4型PRRSV系于2018年在辽宁省报告,由于与IA/2014/NADC34株相似性最高,被命名为NADC34样PRRSV (GenBank:MF326985),具有VR2332 Nsp2基因328-427位对应的100-aa...
图1 系统发育树呈现每个基因组部分的PRRSV-2进化历史,由基于ORF5的祖先谱系或亚谱系着色。星号定位感兴趣分类群的系统发育位置 这项研究由猪健康信息中心和 USDA-NSF-NIH 资助。 原文链接:https://umnswinenews.com/2022/04/29/tracing-the-evolutionary-history-of-the-novel-prrsv-2-l1c-1-4-4-variant/#mor...
PRRSV-2毒株分为九个分支(L1-L9)。 目前广泛流行的主要是PRRSV-2,具有高度的遗传多样性,9个分支可以进一步划分为几个亚分支。 其中PRRSV-2的L1分支在美国和亚洲养猪业中最普遍和最多样化,具有全球流行的趋势。 美国:到2021年,L1分支(NADC30-like和NADC34-like)仍然是最普遍和最多样化的谱系。