今天我们就来介绍另外一个数据库:ProteomeXchange。 顾名思义,这是一个蛋白质组学的数据库,在蛋白质组学如此火的今天,很多课题组把蛋白质组学实验的结果上传到PX,这就形成了另外一个宝藏。 ProteomeXchange的网址:/,打开后主页是这样的: 同样的,我们既可以查看数据,又可以提交数据: 大家想必对查看数据最感兴趣,单击Acces
首先我以甲状腺乳头状癌为例,检索了一下: http://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD000996 这个网址有时是打不开的,很多人说是国外的服务器慢,要用VPN。我检索的是甲状腺乳头状癌,这里面的数据不多,而且测的都是近二年的,看来,很多东西都很新,蛋白组学将可能成为研究热点。 DataSet Su...
Instrument: LTQ Orbitrap 数据要用FTP下载,有40多G的数据,下载也很慢。 从可以看出所用的设备,是LTQ Orbitrap,这公司是thermofish的产品,我于是想到要去下载这个软件Xcaliber,这个软件是用来打开RAW文件的,软件也很难找到,官方网站没看到提供下载的链接,我是偷来的哦,我们可以打开看下: 这个软件我没用过,不过功...
今天我们就来介绍另外一个数据库:ProteomeXchange。 顾名思义,这是一个蛋白质组学的数据库,在蛋白质组学如此火的今天,很多课题组把蛋白质组学实验的结果上传到PX,这就形成了另外一个宝藏。 ProteomeXchange的网址:http://www.proteomexchange.org/,打开后主页是这样的: 同样的,我们既可以查看数据,又可以提交数据: ...
当然，除了GEO和TCGA外，这种公开的数据库还有很多，GEO收录的信息包括了RNA表达、SNP、甲基化、蛋⽩结合以及蛋⽩表达等的数据，TCGA更偏重于从肿瘤⽅向研究RNA和蛋⽩表达、拷贝数突变、预ProteomeXchange。 顾名思义，这是⼀个蛋⽩质组学的数据库，在蛋⽩质组学如此⽕的今天，很多课题组把蛋⽩...
ProteomeXchange的⽹址：http://www.proteomexchange.org/，打开后主页是这样的： 同样的，我们既可以查看数据，⼜可以提交数据： ⼤家想必对查看数据最感兴趣，单击Access Data后新打开的界⾯： 我们可以看到⾸先展⽰的是收录的物种、关键词和仪器，下⾯就是搜索框，我们就可以进 ⾏搜索了，...
当然,除了GEO和TCGA外,这种公开的数据库还有很多,GEO收录的信息包括了RNA表达、SNP、甲基化、蛋白结合以及蛋白表达等的数据,TCGA更偏重于从肿瘤方向研究RNA和蛋白表达、拷贝数突变、预后等结果。今天我们就来介绍另外一个数据库:ProteomeXchange。 顾名思义,这是一个蛋白质组学的数据库,在蛋白质组学如此火的今天,很...