1、conda 安装 conda install prodigal 2、源码安装 # 将预编译文件克隆到本地 git clone https://github.com/hyattpd/Prodigal.git # 切换到预编译文件所在目录 cd Prodigal/ # 运行安装程序 make install # 调用主程序查看帮助 prodigal Prodigal的使用 # 预测单个基因组的ORFs prodigal -i test_genome.fasta ...
参考博文2:基因预测工具:Prodigalhttp://wap.sciencenet.cn/blog-2379401-1085480.html 一、软件安装(以下都是在自己想要安装的安装目录下进行的) wget https://github.com/hyattpd/Prodigal/releases/download/v2.6.3/prodigal.linux wget https://github.com/hyattpd/Prodigal/archive/v2.6.3.tar.gz tar -zxvf...
Prodigal的安装有多种方式，其中一种是通过conda进行安装，步骤如下：首先，将预编译文件克隆到本地，随后切换到预编译文件所在目录，最后运行安装程序。安装完成后，通过调用主程序并查看帮助信息，可以了解其基本使用方法。Prodigal的使用主要涉及两个方面：单个基因组的ORF预测和宏基因组数据集的ORF预测。在...