Primer-BLAST是NCBI中提供的引物设计工具,将BLAST与全局对准算法相结合,可以一步到位地设计特异性引物,并且可以验证已知引物的特异性,是科研牛马赖以生存的好伙伴。 1.打开NCBI官网,选择BLAST 2.选择Primer-BLAST 3.Primer-BLAST 的输入 进入页面后,具体分为4个部分,分别为PCR Template、Primer Parameters、Exon/intron...
Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。Primer-Blast 可以直接从Blast主页(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)找到, 或是直接用下面的链接进入:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/这个工具整合了目前流行的 Primer3 软件,再加上NCBI 的Blast 进行引物特异性的验证。 Pr...
但也不是说Primer-Blast一点实际意义没有,比如在上述EGFR案例,可以准确判断一对引物是否能够将该基因的所有转录变体覆盖到。NCBI的引物设计工具凭借基因序列直达引物设计的入口、其丰富的设置选项、特异性预测的功能还是得到了广大科研工作者的青睐,熟悉掌握了该工具,将为您的分子生物学实验起到很大帮助。
使用NCBI Primer BLAST设计qPCR引物教程无非一梦 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 300 0 21:04 App PCR Primer Design【PCR引物设计】 2224 0 08:53 App 学一下医学/生物实验室日常使用英文短语们 1.3万 1 09:45 App 细菌接种/不同平板划线方法哪个最好?How to streak for single ...
1. 打开NCBI的primer -blast工具,网址如下: 2. 输入文献中的引物序列: 3. 等待片刻,得到blast的结果: 我们在阅读文献的时候,会关注里面的一些基因,并且想通过下载这些基因序列进行进一步分析。但是,由于文章中的基因序列并没有给出所在的数据库的登录号,因此我们并不能直接知道文章作者中研究的完整CDS序列。但是,...
Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。这个工具整合了Primer3软件,再加上NCBI的Blast进行引物特异性的验证。将设计好的引物程序直接用Blast进行引物特异性验证。Primer-BLAST能设计出只扩增某一特定剪接变异体基因的引物。 Primer-BLAST可以从两种途径进入: ...
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Smart blast 主要是用来blast蛋白质的。 界面非常简单,只需要输入你的序列即可(懒人福利)。 下面是我从NCBI上找了一段序列来测试的结果。 结果图 这是结果图,它会自动给你推荐几个最匹配的结果。 注意左边的树不能直接拿来用。。只是参考,还是要自己弄的。右边绿色条是和你的片段blast上的。
Primer-BLAST: NCBI 的引物设计和特异性检验工具 一、 Primer-BLAST 介绍 Primer-BLAST, 在线设计用于聚合酶链反应(PCR) 的特异性寡核苷酸引物。 Primer-Blast 可以 直接从 Blast 主页 ( http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/) 找到 , 或是直接用 下 面的 链接进入:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer...
【⼲货】NCBI中使⽤Primer-BLAST⼯具进⾏引物设计和特异性检验⼀、关于Primer-BLAST Primer-BLAST,在线设计⽤于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。这个⼯具整合了 ⽬前流⾏的Primer3 软件,再加上NCBI 的Blast 进⾏引物特异性的验证。Primer-BLAST 免除了⽤另⼀个站点或⼯具设计引物...