1,首先需要得到待克隆的基因的CDS序列,上游UTR约250bp,下游UTR约250bp。将上游250bp和CDS序列和下游250bp拼起来,ctrl+C复制。 2,打开Primer Premier 5软件(自行激活),选择DNA Sequence。 3,把序列粘贴到空白面板处,弹出的框框直接点OK。 4,再点Primer。 5,在弹出的框框中点search。 6,
Primer Premier 5.0引物设计流程 目录 1.导入基因序列 2.设置引物搜索参数 3.评估引物参数 4导出结果数据 4.1导出所选引物对信息 4.2导出表格中的信息 1.导入基因序列打开软件,单击左上角“File”→“New”→“DN…
首先把光标放在引物的位置,将引物向后移动一个,看下图可以观察到引物向后移动了一个碱基,长度增加了,此时点击Edit Primers。 删除6个碱基后点击Analyze(分析)(删除几个碱基视情况而定) 最后的结果 5' CACTGACTGCCAGAAGACC 3' 5' TACTCGTTCCAGGACCACC 3' 【如何导出?先打开一个Excel文件】 点击Edit-copy-sens...
首先点击左上角的A(Anti-sense),当图示的引物与A的颜色一直时,表示展示的是Anti-sense,然后把鼠标的光标放在引物的位置左右滑动,调整上下游引物位置。 下图是从3’往右移动了一个碱基,注意引物的长度会增加(只要是滑动了引物,改变了它的位置,长度就会增加,此时需要删除多余的碱基,到合适的长度) 点击Edit Primers,...
一、引物设计step by step 1、在NCBI上搜索到目的基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。 2、用Primer Premier5搜索引物 ①打开Primer Premier5,点击File-New-DNA sequence, 出现输入序...
2,打开Primer Premier 5软件(自行激活),选择DNA Sequence。 3,把序列粘贴到空白面板处,弹出的框框直接点OK。 4,再点Primer。 5,在弹出的框框中点search。 6,弹出这么一个框框,因为用上下游各250bp的UTR作为正/反向引物设计,所以正向引物Sense Primer的位置是1到250。我的这个基因两个UTR和CDS加起来的整体的长度...
1 首先下载安装并激活Primer Premier 5 软件，打开软件，点击左上角，选择“File”→ “New” →“DNA Sequence”，然后复制参考模板DNA序列，在输入框内点击Ctrl+V键，将DNA序列粘贴进来:2 接着点击左上角“Primer”按钮，再点击“Search” 按钮：3 然后选择并输入一些参数，一般最上面点击“PCR Primer”，下面...
怎样用primer premier5.0软件设计引物序列,rimerremier5.0是一款功能很强大的软件,在分子生物学研究中被广泛运用。常被用于PCR反应中最重要的一环———引物设计过程。引物的好坏直接能关系到PCR实验的成功与否,同时在设计引物的时候也需要满足种种条件,因此利用该软件的
primer premier5设计引物的原理 Primer Premier软件设计引物的原理主要基于以下原则: 1.引物长度:以15-30bp为合适,最常用的是18-24bp。 2.引物GC含量:应在40-60%之间。 3.引物碱基分布:应遵守随机性,避免连续出现4个以上的单一碱基,尤其在引物的3端不应该出现连续的G/C。 4.避免自身互补:引物自身不能含有...