1.打开NCBI官网,选择BLAST 2.选择Primer-BLAST 3.Primer-BLAST 的输入 进入页面后,具体分为4个部分,分别为PCR Template、Primer Parameters、Exon/intron selection、Primer Pair Specificity Checking Parameters,其中Exon/intron selection进行设置,可实现跨外显子/内含子的引物设计; 4.PCR Template的输入 导入基因序列...
"How To Create Real-Time PCR Primers Using Primer-BLAST" from YouTube, 视频播放量 2931、弹幕量 0、点赞数 87、投硬币枚数 12、收藏人数 260、转发人数 20, 视频作者 无非一梦, 作者简介 下辈子不学医.,相关视频:PCR Primer Design【PCR引物设计】,学一下医学/生物
二、Primer-BLAST使用步骤1. 打开Primer-BLAST网页,输入目标基因的名称或序列,选择物种,设定引物设计的参数,如引物长度、GC含量、温度等。2. Primer-BLAST将自动查找并比对基因组数据库中的序列,生成潜在的引物候选序列。用户可以根据需要选择合适的引物。3. 用户可以将选择的引物序列输入Primer-BLAST的在线工具中,...
1 首先打开NCBI,选择“Nucleotide”,并在搜索框输入基因名。一般用目标基因的突变体1去设计引物,也就是要选择目标基因的“transcript variant 1, mRNA ”,没有1就用2、3,以此类推。因为是Q-PCR,所以要去掉内含子,因此用mRNA。2 从上一个页面点击FASTA,可以看到mRNA的序列。3 搜索“NCBI BLAST”并点击进...
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Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。Primer-Blast 可以直接从Blast主页(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)找到, 或是直接用下面的链接进入:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/这个工具整合了目前流行的Primer3软件,再加上NCBI 的Blast 进行引物特异性的验证。
1. 打开NCBI的primer -blast工具,网址如下:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index...
Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应( PCR)的特异性寡核苷酸引物。Primer-BLAST 可以直接从Blast主页 ( http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/) 找到,或是直接用下面的链接进入: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ 这个工具整合了目前流行的Primer3软件,再加上NCBI的Blast进行引物特异性的验证。
打开NCBI,进入Blast,网页如下: 点击上图红框标记的Primer-Blast,进入如下界面,在界面引物序列处,将正反向引物序列粘贴进去,5-3方向。产物大小默认为70~1000,可以根据实际情况进行调整。 选择相应的物种和参考数据库。 首先,要确保Specificity check一栏中已经打勾。Search mode一般选择Automatic即可。
1. 进入NCBI BLAST 2. 进入Primer-BLAST 3. 输入模板序列,根据要求:是否跨外显子设计引物,产物长度,退火温度,GC含量等设置参数。 4. 耐心等...