导读:分子相互作用网络图揭示了细胞内部分子间的复杂相互作用。通过识别网络中密集连接的节点所形成的社区(community),可以揭示它们之间以前未知的功能联系。这些社区可能代表了具有共同功能的功能模块,对于理解细胞生物学过程、疾病机制以及药物靶点的识别具有重要的科学和临床价值。 《Clinical and Translational Medicine》文...
下载: 全尺寸图片 幻灯片 蛋白相互作用(PPI)网络图 2022, 43(12): 36-45. 基于网络药理学探讨山楂叶抗高脂血症的作用机制及初步验证 . 相关文章超声改性对蓝莓果胶与矢车菊素-3-O-葡萄糖苷相互作用的影响 2024, 45(19): 49-57. DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2023100124 基于网络药理学及分子对接...
然而,利用标签图进行多标签学习主要适用于视觉领域,尚未扩展到PPI预测任务中。 总体而言,一个理想的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)预测框架应该是高效、可迁移和可泛化的,然而,由于不完美的数据集导致的两个主要瓶颈阻碍了这些模型的发展。标签稀缺性:尽管通过各种计算和实验方法在PPI研究中取得了巨大进展,但仍需从实验...
为提高蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)预测的准确性,并深入探索细胞信号传导和疾病发生的生物学机制,本文提出一种简称为CBSG-PPI的预测算法.该算法首先利用3层前馈网络来处理蛋白质的k-mer特征,采用CT方法和Bert方法提取蛋白质的氨基酸序列以及使用卷积神经网络提取蛋白质的序列特征,再结合图神经...
本文以蛋白质-蛋白质相互作用数据为例,展示了如何使用微生信云平台在线绘制带community的分子相互作用网络图。 1,打开作图URL https://www.bioinformatics.com.cn/basic_protein_protein_interaction_network_by_igraph_256 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。
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检查通过,并且参数选好后,点击“提交”按钮,约3s后,会在页面上显示带community的彩色PPI相互作用网络图。我们提供了pdf、svg两种矢量图,png、tiff两种标量图供大家下载使用。可以使用acrobat illustrator等软件编辑矢量图,进行组图,调整文字位置,添加说明等操作,以满足个性化需求。
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