在遇到P值和FDR值已经卡过阈值但差异代谢物仍较多的情况下,可以通过卡VIP值进一步筛选差异代谢物,通常以VIP值>1作为筛选标准。对于PLS-DA和OPLS-DA分析,结果中的R2X和R2Y分别表示所建模型对X和Y矩阵的解释率,Q2标示模型的预测能力,它们的值越接近于1表明模型的拟合度越好,训练集的样本越能够被准确划分到其原始...
R2X和R2Y分别表示PLSDA分类模型所能够解释X和Y矩阵信息的百分比,Q2Y则为通过交叉验证计算得出,用以评价PLS-DA模型的预测能力,Q2Y越大代表模型预测效果较好。 关键数值参数提取:根据PLS-DA的建模结果,提取一系列关键数值并写入表格,并且进行进一步可视化。 得分矩阵,存储在结果文件“scoreMN.xls”中。 结果文件:得分...
箭头表示本OPLS-DA模型准确率所在的位置,其中R2X和R2Y分别表示所建模型对X和Y矩阵的解释率,Q2表示模型的预测能力,理论上R2、Q2数值越接近1说明模型越好,越低说明模型的拟合准确率越差,通常情况下,R2和Q2高于0.5较好,高于0.4即可以接受。
其中R2X和R2Y分别表示所建模型对X和Y矩阵的解释率, Q2表示模型的预测能力,理论上R2、Q2数值越接近1说明模型越好,越低说明模型的拟合准确性越差。通常情况下 , R2、Q2高于0.5较好,高于0.4即可接受。 从图中可以看出Q2为0.994 , R2Y为1 , R2X为0.685 , Q2和R2Y的P值均小于0.01,说明 permutation test 中随...
在偏最小二乘判别分析(PLS-DA)中,R2表示模型对数据的拟合程度,而Q2表示模型的预测能力。理想情况下,R2应该接近1,而Q2也应该是正值,越接近1越好。 在进行交叉验证时,R2和Q2的截距值可以帮助判断模型是否有过拟合的倾向。 R2截距(R2Y和R2X的截距)接近0更好,说明模型没有捕捉到随机噪声,而是真实反映了数据间的...
近红外光谱结合PLSDA鉴别不同产地的川续断