PLS_DA 我在第一次使用的时候用于代谢组数据的区分,样本数量少,并且组件区分不是很明显。后来也就无所谓是什么数据了,作为一种降维方法,运用于什么组学倒是无所谓,只要找到我们需要的差异,也就好了。还记得第一次使用这个R包是17年mixOmics,用于PLS-DA分析等...
OPLS-DA PLS-DA Metaboanalyst PCA 协和 科研 医学 主成分分析 降维 代谢组学 开心doctor 发消息 让医学科研有迹可循!公主号“观科研”,“inHEART",红宝书“开心doctor",科研咨询请见商品橱窗。合作可私聊。 充电 关注18.2万 非靶向代谢组学 1/2 创建者:一方红布 收藏 临床医生做基础科研——21.组学...
例如,在代谢组学研究中,成分的分离可能与特定生物标志物或代谢途径相关。 理解PLS-DA的结果需要结合具体的研究背景和数据特性。在解读结果时,应该注意不仅仅依赖于图形本身,还要结合其他统计分析结果,如模型的预测准确度、交叉验证结果等,以综合判断模型的有效性和可靠性。
PLS-DA图的解释需要结合实验设计和研究背景。例如，在代谢组学研究中，成分的分离可能与特定生物标志物或代谢途径相关。理解PLS-DA的结果需要结合具体的研究背景和数据特性。在解读结果时，应该注意不仅仅依赖于图形本身，还要结合其他统计分析结果，如模型的预测准确度、交叉验证结果等，以综合判断模型的有效...
可以初步了解各组样本之间的总体代谢物差异和组内样本之间的变异度大小,并可通过分析QC样本进行质量控制。 偏最小二乘法判别分析(Partial Least Squares Discrimination Analysis,PLS-DA)是一种有监督的判别分析方法,是多变量统计分析方法。判别分析是一种根据观察或测量到的若干变量值,来判断研究对象如何分类的常用统计...
视频地址: 临床医生做基础科研——21.组学数据处理之PCA_PLSDA_OPLSDA 听说政治家都是语文狂 粉丝:3文章:2 关注Vip 在许多代谢组学中可使用。分享到: 投诉或建议 评论0 最热 最新 请先登录后发表评论 (・ω・) 发布1 0 5 0 登录后你可以: 免费看高清视频 多端同步播放记录 发表弹幕/评论 热门番剧...
百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商 相关服务: PLS-DA/OPLS-DA二维图 代谢组学生物信息学分析 代谢组学 代谢组学数据质量评估 主成分分析(PCA) 数据归一化分析 单变量统计分析 差异代谢产物聚类分析 KEGG差异代谢产物通路分析
从代谢组学分析产生的海量数据中发现潜在标志物, 需要借助多变量模式识别方法. 无师监督的模式识别方法包括主成分分析(PCA、聚类分析(HCE)等; 有师监督的方法包括判别分析(DA)、偏最小二乘分析(PLS) 、偏最小二乘判别分析(PLS-DA),正交校正的偏最小二乘分析(OPLS)等. 当变量数量远大于样品数量时, PLS或 PL...
基于液相色谱-质谱联用技术的 肺癌细胞代谢组学分析J. 色谱, 2013, 31(7): 691 -69617 徐丹, 孟宇, 胡波, 等. 基于 HPLC-MS/MS Q-TOF 分析糖 尿病 肾病维持性血 透患者含糖 透析的 代谢特征 J. 中国 病理生理杂志, 2013, 29(3): 455 -461.18 陈保, 姜东华, 吕生, 等. 云抗 10 号大叶种...
不同于PCA是用来看整体的变化趋势,而PLS-DA则是用来筛选不同组之间的差异代谢物,利用这个分析方法,我们可以得到需要重点关注的代谢物,这些代谢物是引起不同处理或者不同组之间差异的主要贡献者,在完成PLS-DA分析后,我们会获得分析得到的一个参数,VIP值,变量重要性投影,该值的大小就表明该代谢物对于分离两组之间的...