1.3D-QSAR的构建 ①导入训练集分子 在文件浏览器中,点击Samples>Tutorials>QSAR,双击trainingset.sd,导入本次教程所需的14个训练集分子。②导入测试集分子 在文件浏览器中,点击Samples>Tutorials>QSAR,双击testset.sd,导入8个测试集分子。 训练集分子与测试集分子均事先进行了叠合,一般可直接基于小分子的公共骨架进...
结论:PLS-QSAR模型可作为一个重要的方法用于纳米金属氧化物的毒性预测,对于变量选择和主成分确定的策略需要结合数据特征具体探讨.%OBJECTIVE:To explore the application of partial least squares-quantities structure activity relationship (PLS-QSAR) model to predict the bacterial toxicity of nanometer metal oxide,...
PLS.Vm-Q2。。方法以旦‘,.为主要判据,VII'为辅助判据.对变量空问进行相当广泛地搜索,较前两种方法有 较大的可能寻技到最优模型。在本部分的研究中,后两种方法的性能相近,但向后PLS・Vm-Q2。。方法较优。 关键词PLS;变量选择;QSAR 0引言 在有机污染物QSAR研究中,为了不遗漏对活性有显著解释意义的分子结...
随着大量分子描述符应用于QSAR/QSPR,如何筛选出具有良好稳定性和预测能力的描述符集,成为亟待解决的一个瓶颈问题.将63个有机化合物的1664个描述符经过初步预选后,利用偏最小二乘(PLS)方法进行变量筛选,获得42个重要描述符|随机选择43个有机物,针对透聚乙烯膜性能进行训练研究,得优良估计能力和良好稳定性模型(A=6...
PLS和SVM应用于有机污染物K-%2cp-的QSAR研究.doc,第四届全国环境化学学术大会论文集(下册) PLS和SVM应用于有机污染物峰的QSAR研究 于海瀛陈景文‘ (大连理工大学工业生态与环境工程教育部重点实验室,环境科学与工程系,大连,116024) 摘要有机污染物在
说明利用PLS变量筛选法,能获得重要相关变量,建立起具备良好性能的QSAR模型.同时,把该方法应用到对人体小肠吸收,经皮吸收和透胎盘屏障特性的模型分析中,获得良好性能QSAR模型.借助原始变量的投影重要性指标VIP来分析,与活性的重要相关的描述符,PLS变量筛选法为QSAR/QSPR研究中从大量描述符中提取具有良好稳定性和预测能力...
ADMET Modeler is a module that automates the difficult and tedious process of making high quality predictive QSAR/QSPR models from experimental data sets.
QSARCXCR2 receptorin silico screeningestimation of pIC50Genetic algorithms(GA)are an effective optimization method,and partial least squares(PLS)are a well\\|known multivariate statistical method.The combination of two methods is proposed to construct GA\\|based PLS analysis,which is applied to QSAR...
PLS和GA应用于部分有机污染物的QSAR研究 在建模过程中,提出并采用了三种适用于大样本QSAR研究的变量选择方法:①基于逐步回归分析的变量选择方法;②基于变量投影重要性参数VIP的变量选择方法;③基于PLS模型的Q... 丁光辉 - 《大连理工大学》 被引量: 28发表: 2006年 ...
QSAR Study on ACE Inhibitors by Using OSC-PLS Algorithm. Hai-Xia Long,Yuan-Qiang Wang,Yong Lin. JOURNAL OF THE CHINESE CHEMICAL SOCIETY . 2010Long, H. X.; Wang, Y. Q.; Lin, Y.; Lin, Z. H. QSAR study on ACE inhibitors by using OSC-PLS algorithm. J. Chin. Chem. Soc-Taip. ...