方法:应用PLS-QSAR模型分析纳米金属氧化物的结构描述符与细菌毒性之间的关系,分别采用3种主成分确定方法和4种变量选择方法建立模型,并对所建模型进行内部验证和外部验证,评价模型的预测能力和可解释性,以确定最优模型。结果:结合变量重要性指标(VIP)和交叉验证指标的向前变量选择法(FPVQ)和基于检验的主成分2 2 2...
基于PLS变量筛选法的QSAR模型快速评价药物的ADME活性重庆大学博士学位论文学生姓名:张永红指导教师:夏之宁教授专业:生物医学工程学科门类:工学重庆大学生物工程学院二O一三年四月
1.3D-QSAR的构建 ①导入训练集分子 在文件浏览器中,点击Samples>Tutorials>QSAR,双击trainingset.sd,导入本次教程所需的14个训练集分子。②导入测试集分子 在文件浏览器中,点击Samples>Tutorials>QSAR,双击testset.sd,导入8个测试集分子。 训练集分子与测试集分子均事先进行了叠合,一般可直接基于小分子的公共骨架进...
PLS.Vm-Q2。。方法以旦‘,.为主要判据,VII'为辅助判据.对变量空问进行相当广泛地搜索,较前两种方法有 较大的可能寻技到最优模型。在本部分的研究中,后两种方法的性能相近,但向后PLS・Vm-Q2。。方法较优。 关键词PLS;变量选择;QSAR 0引言 在有机污染物QSAR研究中,为了不遗漏对活性有显著解释意义的分子结...
说明利用PLS变量筛选法,能获得重要相关变量,建立起具备良好性能的QSAR模型.同时,把该方法应用到对人体小肠吸收,经皮吸收和透胎盘屏障特性的模型分析中,获得良好性能QSAR模型.借助原始变量的投影重要性指标VIP来分析,与活性的重要相关的描述符,PLS变量筛选法为QSAR/QSPR研究中从大量描述符中提取具有良好稳定性和预测能力...
QSARCXCR2 receptorin silico screeningestimation of pIC50Genetic algorithms(GA)are an effective optimization method,and partial least squares(PLS)are a well\\|known multivariate statistical method.The combination of two methods is proposed to construct GA\\|based PLS analysis,which is applied to QSAR...
PLS和SVM应用于有机污染物K-%2cp-的QSAR研究.doc,第四届全国环境化学学术大会论文集(下册) PLS和SVM应用于有机污染物峰的QSAR研究 于海瀛陈景文‘ (大连理工大学工业生态与环境工程教育部重点实验室,环境科学与工程系,大连,116024) 摘要有机污染物在
PLSA QSAR study has been carried out on antimalarial activity and cytotoxicity of substituted 4-aminoquinolines using topological and structure descriptors from DRAGON software. The descriptors, relevant to each activity, were identified by Combinatorial Protocol in Multiple Linear Regression (CP-MLR) ...
Quantum chemistry calculations were made on 28 3-methylfentanyl derivatives,whose indices were further used in the QSAR study.The PLS method was used for data process.By using only 4 components,a highly predictive QSAR model was constructed for 25 compounds.The results showed that the bioactivities...
A QSAR study using Multiple Linear Regression (MLR) and a Partial Least Squares (PLS) methodology was performed for a series of 127 derivatives of 1-(2-hydroxy-ethoxy)methyl]-6-(phenylthio)-timine (HEPT), a potent inhibitor of the of the human immunodeficiency virus type 1, HIV-1 ...