1.得分图(Score Plot): 得分图通常用于展示样本在PLS-DA模型中的分布。每个点代表一个样本,不同的颜色或形状可以代表不同的类别。通过观察点的分布,可以了解不同类别之间是否有明显的区分。如果不同类别的点在图中清晰分离,则说明模型在这些类别上有良好的区分能力。 2.负荷图(Loading Plot): 负荷图展示了原始...
1.得分图(Score Plot):得分图通常用于展示样本在PLS-DA模型中的分布。每个点代表一个样本,不同的颜色或形状可以代表不同的类别。通过观察点的分布,可以了解不同类别之间是否有明显的区分。如果不同类别的点在图中清晰分离,则说明模型在这些类别上有良好的区分能力。2.负荷图(Loading Plot):负荷...
成分分析:分析获得的成分,理解其与原始变量之间的关系。可以通过载荷图(loading plot)和得分图(score plot)来可视化成分。 模型评估:使用R²值和Q²值等指标评估模型的拟合优度和预测能力。R²值表示模型解释的方差比例,Q²值则用于评估模型的预测能力。 5. 结果解读与应用 PLS分析的结果需要进行详细解读。...
通过 Score plot 图,可以看出不同样本之间的差异,从而找出那些最能区分不同类别之间差异的主要特征。5.S-plot 图:S-plot 图是一种二维散点图,用来展示每个自变量在不同类别之间的差异,可以更直观地看出每个自变量在分类中的重要程度。S-plot 图上的点越靠近两端,说明该变量对不同类别之间的差异...
“x-score”: ‘correlation’: 变量和各成分的相关性图 ‘x-loading’: 贡献较大的组分被红色标记 parAsColFcVn score plot 中的着色参数 parEllipsesL 是否显示椭圆 fig.pdfC interactive’ (default):图像随opls函数运行而显示 ‘none’:不显示图片 ...
得分图(Score Plot):观察样本在主要成分上的分布,了解样本间的相似性和差异性。 负荷图(Loading Plot):分析哪些变量对模型的分离能力贡献最大。 7. 结果分析 根据得分图和负荷图分析样本间的关系和关键变量。 结合生物学知识对结果进行解释。 8. 报告
PLS-DA score plot and validation plot for lysate samples.Priti, BahetyYee Min, TanYanjun, HongLuqi, ZhangEric, Chun Yong ChanPuiLai, Rachel Ee
得分图(Score Plot):观察样本在主要成分上的分布,了解样本间的相似性和差异性。负荷图(Loading Plot):分析哪些变量对模型的分离能力贡献最大。7. 结果分析 根据得分图和负荷图分析样本间的关系和关键变量。结合生物学知识对结果进行解释。8. 报告 制作报告,包括模型参数、图表以及模型的生物学或...
x-score plot(右下) :各样本在PLS-DA轴中的坐标;R2X、R2Y等值展示在下方,用于评估模型优度:与其说是可视化方法,不如称为数据提取章节。通过变量投影重要度(Variable Importance for the Projection,VIP),可以衡量各代谢物组分含量对样本分类判别的影响强度和解释能力,辅助标志代谢物的筛选(阈值...
PLS 工具箱 帮助文档 iToolbox Manual by Lars Nørgaard Email: lan@kvl.dk Web: www.models.kvl.dk July 2004