PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis)和OPLS-DA(Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis)中的 Q2 值为负数通常表示模型的预测能力不佳。Q2值是一种交叉验证参数,用于评估模型的预测能力。当Q2值为负数时,意味着模型的预测误差比随机模型还要大。要提高模型的预测能力,您可以考虑调整以下...
主页> 问答中心> 代谢组学FAQ汇总> PLS-DA/OPLS-DA二维图中q2为负值是什么意思 在PLS-DA(偏最小二乘判别分析)或OPLS-DA(正交偏最小二乘判别分析)的二维图中,q²值(Q-squared)衡量的是模型对数据的交叉验证预测效果,理想的q²值应接近1。q²值为负表示模型的预测能力较差,通常意味着模型未能有效地捕...
PLS-DA(偏最小二乘判别分析)是一种结合降维与分类功能的多变量统计方法,适用于高维度数据的分组差异分析。其通过构建潜在变量最大化组间差
分别建立两两分组比较的PLS-DA模型或OPLS-DA模型,模型得到的参数评价会以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分别表示所建模型对X和Y矩阵的解释率,Q2标示模型的预测能力,理论上R^2、Q^2数值越接近1说明模型越好,越低说明模型的拟合准确性越差,通常情况下,R^2、Q^2高于0.5 (50%)较好,高于0.4即可接受,且两者...
首先,模型通过排列检验进行了200次的交叉验证,这一过程中,Q2回归线与纵轴的相交点小于零(R2=0.369, Q2=-0.826),这一关键指标直接证明了PLS-DA模型的稳健性和可靠性。此外,Q2和R2的数值虽然看似不直观的高相关性,但实际上在模型验证中,Q2的负值表明模型在预测未知样本时能够有效避免过拟合,从而增强了结果的可靠...
表1 PLS-DA模型的评价参数 注:表中A:表示主成分数;R2X:表示模型对X变量解释率;R2Y:表示模型对Y变量的解释率;Q2:表示模型预测能力。 四、差异代谢物筛选 ORIGINGENE 1) OPLS-DA模型得到的变量权重值(Variable Importance for the Projection, VIP)用于衡量各代谢物的表达模式对样本分类判别的影响强度和解释能力...
从图中可以看出Q2为0.994,R2Y为1,R2X为0.685,Q2和R2Y的P值均为0.005,说明permutation Test中只有1个随机分组模型结果优于本OPLS-DA模型,一般情况下P<0.05时模型较佳。 松哥统计说 R在生信领域可谓风风火火,R包中的ropls包可以进行PCA、PLS-DA和OPLS-DA分析。SIMCA-P 软件也可以进行OPLS-DA分析。具体实现...
由上图,PLS-DA模型的R2Y和Q2Y与随机置换数据后获得的相应值进行比较。 左下图,展示了各样本在投影平面内以及正交投影面的距离,具有高值的样本标注出名称,表明它们与其它样本间的差异较大。颜色代表性别分组。 右下图,各样本在PLS-DA轴中的坐标,颜色代表性别分组。我们可以看到,相对于上文的PCA(仅通过方差特征...
Q2 值是PLS-DA/OPLS-DA中用于描述模型预测能力的统计量。具体地说,Q2 描述的是模型的预测平方相关系数。在建模过程中,Q2 是通过交叉验证得到的。正的 Q2 值表示模型对待预测数据集有一定的预测能力;而负的 Q2 值通常意味着模型对待预测数据集的预测能力很差,或者模型过度拟合。