比如常见的PCA、NMDS、PCoA及一些聚类算法(如k-means聚类),这些都是无监督模型。 02 有监督模型之判别分析Discriminant Analysis(DA) 有监督模型判别分析常见几类:线性判别分析(LDA)、偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)、正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)。 说到判别分析,我们不得不提一下在微生物中常用的LEfSe...
1.PLS-DA分析 偏最小二乘判别分析(Partialleast squares discriminant analysis,PLS-DA)是多变量数据分析技术中的判别分析法,经常用来处理分类和判别问题。通过对主成分适当的旋转,PLS-DA可以有效的对组间观察值进行区分,并且能够找到导致组间区别的影响变量。PLS-DA采用了经典的偏最小二乘回归模型,其响应变量是一组...