如果你的样品之间相关性不强,这时候主成分分析降维的效果其实不太好,就可以试试这种有监督的学习方法---PLS-DA来代替PCA。 首先我们构建一下数据(随便找的,没有意义),行名为基因,列名为样本。 我们做下PCA看看效果。 setwd("F:/生物信息学/PLS-DA") A <- read.csv("pl.csv",header = T,row.names =...
Matlab实现PCA-PLS主成分降维结合偏小二乘回归预测(完整源码和数据) 1.输入多个特征,主成分降维后输入偏小二乘进行回归; 2.算法新颖,包含评价指标MAE、R2等,出图多(误差图、帕累托图)～ 3.运行环境Matlab2018b及以上。 程序设计 完整程序和数据获取方式(资源出下载):Matlab实现PCA-PLS主成分降维结合偏最小二乘...
偏最小二乘判别分析(PLSDA): PLSDA 是一种适用于多变量数据的降维方法,它通过最小化类内散度矩阵来找到最佳的投影方向。PLSDA 的步骤如下: 对每个类别进行主成分分析(PCA)。 计算类内散度矩阵和类间散度矩阵。 计算广义特征值问题的解,得到投影矩阵。 将数据投影到低维空间中。 最大均值差异分析(MMDA): MM...
近红外光谱数据和HPLC 测得浓度联合建立PLS定量分析模型 1、测得近红外光谱数据,进行预处理:多元散射校正(multiplicative scatter correction,MSC)、一阶导数(first derivative,1FD)、… 研路学子发表于建模分析 A level 化学核心知识点20:红外光谱分析法(视频讲解) 爱讲课的月...发表于A lev... 红外光谱(Infrared...
摘要 一种基于BaggingPLS和PCA的降维方法属于模式识别领域,具体为一种基于BaggingPartialLeastSquares(Bagging偏最小二乘,BaggingPLS)和PrincipalComponentAnalysis(主成分分析,PCA)的降维方法。根据原始数据集生成子训练集并求得PLS回归系数向量;把PLS回归系数向量组成的矩阵作为PCA算法的输入以生成最终的PrincipalModelAnalysis...
1.一种基于baggingpls和pca的降维方法,包括以下步骤: 步骤1:生成子训练集,并在每个子训练集上求pls回归系数向量; 步骤2:利用步骤1求得的pls回归系数向量生成最终的pma模型。 2.所述步骤1包括使用替换方法从原始训练集生成n个子训练集。在每个子训练集上求回归系数向量,记作βi,(i=1,...,n),其中的潜变量...
( , ) 西北工业大学 自动化学院 陕西 西安 710072 : , , 摘要 为了提高车辆视频检测和训练速度 针对车辆视觉特征维数较高的普遍问题 构造了一种特 , ( ) 、 ; 征降维方法 采用偏最小二乘 PLS 法对包含正 负样本的训练集图像进行分解 通过变量投影重 ( ) , 要性分析 VIP 法评价原始特征对分解结果的...
降维与特征选择中的PLS、PCR-机器学习文档类资源Dr**年パ 上传29.72 MB 文件格式 rar matlab 代码+实例 这是PLS和PCR的两个具体实例,里面包括代码、数据以及相对应的结果,可以直接改相关数据就行~~~点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:13 积分 电信网络下载 ...
其实,如果不做代谢组学或者看这方面的文章,一般学点组学分析的人还真不容易看到PLS-DA,因为常见组学(转录组、蛋白组),文章中一般使用PCA分析降维(转录组不求人系列(三):PCA分析及CNS级别作图),代谢组学使用较多。如果你的样品之间相关性不强,这时候主成分分析降维的效果其实不太好,就可以试试这种有监督的学习方...
偏最小二乘判别分析(PLSDA): PLSDA 是一种适用于多变量数据的降维方法,它通过最小化类内散度矩阵来找到最佳的投影方向。PLSDA 的步骤如下: 对每个类别进行主成分分析(PCA)。 计算类内散度矩阵和类间散度矩阵。 计算广义特征值问题的解,得到投影矩阵。