plotROC - Generate ROC Curve Charts for Print and Interactive Use pROC - display and analyze ROC curves in R and S+ plotROC plotROC包较为简单与单一,它就是用来绘制ROC曲线的,包中定义的函数基于ggplot2,因此我们可以结合ggplot2使用和修改、美化图形结果。 代码语言:javascript 复制 #从GitHub上安装devt...
plotROC- Generate ROC Curve Charts for Print and Interactive Use pROC- display and analyze ROC curves in R and S+ plotROC plotROC包较为简单与单一,它就是用来绘制ROC曲线的,包中定义的函数基于ggplot2,因此我们可以结合ggplot2使用和修改、美化图形结果。 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码...
pROC- display and analyze ROC curves in R and S+ plotROC plotROC包较为简单与单一,它就是用来绘制ROC曲线的,包中定义的函数基于ggplot2,因此我们可以结合ggplot2使用和修改、美化图形结果。 #从GitHub上安装devtools::install_github("hadley/ggplot2")devtools::install_github("sachsmc/plotROC")library(plo...
包绘制ROC曲线图 3.1 基本用法 # 安装并加载所需的R包 # install.packages("plotROC") # remotes::install_github("sachsmc/plotROC") library(plotROC) # 创建数据集 set.seed(2529) D.ex <- rbinom(200, size = 1, prob = .5) M1 <- rnorm(200, mean = D.ex, sd = .65) M2 <- rnorm...
如何将我的图展现在默认浏览器或者Rstudio上? 这时候就可以用到plot_interactive_roc(),具体如下: plot_interactive_roc(basicplot)#点击左上角第三个图标即可在默认浏览器打开#而且可以随意点击看置信区间 或者用export_interactive_roc,创建knit或者Rmd文件,...
考虑到使用ggplot2包绘制的校准曲线置信区间比较宽,比较杂乱,我们直接使用R最基础的plot()函数重新绘制四种模型的校准曲线,不展示置信区间,这样比较简洁,便于区分(见下图)。 B. Calibration Curves in the testset 我们再来看一下Brier评分的结果,Brier评分=∑(Y-P)2/N,其中Y为实际观测概率,P为模型预测概率,N为...
考虑到使用ggplot2包绘制的校准曲线置信区间比较宽,比较杂乱,我们直接使用R最基础的plot()函数重新绘制四种模型的校准曲线,不展示置信区间,这样比较简洁,便于区分(见下图)。 B. Calibration Curves in the testset 我们再来看一下Brier评分的结果,Brier评分=∑(Y-P)2/N,其中Y为实际观测概率,P为模型预测概率,N为...
pROC- display and analyze ROC curves in R and S+ plotROC plotROC包较为简单与单一,它就是用来绘制ROC曲线的,包中定义的函数基于ggplot2,因此我们可以结合ggplot2使用和修改、美化图形结果。 #从GitHub上安装devtools::install_github('hadley/ggplot2') ...
如何用Sigmaplot绘制ROC曲线-临床与病理杂志.PDF,临床与病理杂志 2015, 35(5) 698 J Clin Path ol R e s doi: 10.3978/j.issn.2095-6959.2015.05.002 View this article at: /10.3978/j.issn.2095-6959.2015.05.002 ·AME 科研时间专栏 · 专栏导读 :AME Groups 旗下出版了
单因素COX回归建模依赖于survival包coxph()函数,PH检验依赖于cox.zph()函数。这里的思路是自建一个函数,然后输入需批量操作的基因名vector,和已经加入这些基因normalized counts的survival_cancer信息表。通过R特有的向量化操作lappy同时进行批量计算各基因的风险比,并检验变量是否符合cox等比例风险模型的前提PH假设,得到符...