Hello, I performed trajectory analysis on a dataset containing human monocytes and its progenitor cells. When I tried to plot genes that changed expression over pseudotime I get a plot that looks like this: I c
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遗传算法的先驱John Holland在《Adaptation in Natural and Artificial Systems》一书中指出,遗传算法是"inspired by and loosely based on Darwin’s Theory",收达尔文进化论启发,并且是较为宽松地基于他,不是完全的匹配的;遗传算法是把生物学中的这些概念:Chromosome染色体,Crossover交叉,Mutation变异,Selection选择(Sur...
1. 使用 plot_used <- plot_genes_in_pseudotime(monocle_object[gene_used, ], color_by="seurat_clusters", relative_expr=T, cell_size = 1, nrow = 2, ncol = 2)+NoLegend() plot_used$data$expectation '#每个细胞的表达量 plot_used$data$expression #每个时间点的表达均值 2. 基因表达拟合 官...
plot_genes_in_pseudotime() 中的 relative_expr=T时,对数据的标准化过程 图片.png 1. 获得最初UMI-matrix UMI-matrix <- monocle2_object_used@assayDara$exprs 2. 计算每个细胞的size-factor monocle2_object_used <- estimateSizeFactors(monocle2_object_used) ...
plot_genes_in_pseudotime合并两个基因到一个图 plot合并地皮,CAD常用快捷键命令汇总L直线A圆弧C圆T多行文字XL射线B块定义E删除I块插入H填充W定义块文件TR修剪CO复制EX延伸MI镜像PO点O偏移S拉伸F倒圆角U返回D标注样式DDI直径标注DLI线性标注DAN角度标注DRA半径标注OP系统选