这个图的做法和之前我们写过的ggplot做火山图同根同源(ggplot做火山图—添加任意基因标签|||突出显示标记基因)。我们的复现结果基本和这篇NC是一样的,有以下特点: 1、上下调基因阈值使用曲线。 2、上下调基因用不同颜色显示,且大小自定义,并显示基因名称。 ****================================================
image.png 根据上图确实可以看出学术期刊的作者数量确实是有增加的趋势的 这里新学到的知识点是使用stat_summary()函数添加置信区间,之前自己也实现过这个图,但是需要提前算好置信区间和平均值,比如之前的推文R语言ggplot2画带有置信区间的折线图和分组求均值遇到的一个问题,如果换成stat_summary()这个函数以后就方便...
但经常使用 ggplot 童鞋可能知道,我们没有办法直接只用上述的数据在 ggplot 中进行绘制,需要进行一个变换,也就是将销售额与增长率并列,并且再加一列变量作为 index,具体操作我们可以使用管道数据处理的 package :tidyr。(具体的原因与使用方法可参见:tidyr+ggplot2多个变量分层展示) library(tidyr) dat_overview %>...
ggplot(data, aes(x, y))+# Draw ggplot2 plotgeom_line()+geom_point() As shown in Figure 1, we created a line and point plot (i.e. a graph where the lines connect the points) using the ggplot2 package with the previously shown R syntax. ...
在R语言中，利用ggplot2包绘制箱线图的步骤如下：准备数据：这是绘制箱线图的关键步骤，确保你的数据已加载到R环境中，并且格式正确。基础箱线图构建：使用geom_boxplot函数来绘制基础的箱线图。例如：Rlibraryggplot, y = Value)) + geom_boxplot其中，data是你的数据框，Group是分组变量，Value是...
我们一般需要ggplot2、reshape2两个包。我们先加载包并读取所需的绘图数据。 # 加载R包 library(ggplot2) library(reshape2) # 读取双向柱形图数据文件library(readxl) #加载包 zzdata <- read_excel("C:/Users/LENOVO/Desktop/双向柱状图.xlsx") zzdata # 把数据转换成ggplot常用的类型(长数据) datazz = ...
书接上回: R语言clusterProfiler包GO富集分析(enrichplot包、GOplot包和ggplot2绘图)通过某些方法(如差异基因、相关基因等)获得一批基因后,可以进行功能富集分析(包括GO和KEGG富集分析),以了解这些基因的…
本篇教程将指导你在 R 语言中利用 ggplot2 包绘制箱线图。首先，通过 geom_boxplot() 函数实现基础箱线图构建：1. 准备好你的数据，这是关键步骤。为了更详细展示数据特性，可以利用 stat_summary() 添加平均点：2. 通过选择要展示的项目，定制你的箱线图内容。如果你想在箱线图中添加点状图或...
Example 3: Add Multiple Line Segments to ggplot2 Plot It is also possible to append multiple line segments to a ggplot2 plot. For this, it makes sense to define all the parameters of our lines in a data frame object first: data_lines<-data.frame(x=2:4,# Create data for multiple seg...
之前我们学习了ggplot绘制单变量，两个连续变量的图形，两个离散型变量。对于一个离散型变量，一个连续型变量，有很多作图方式，包括箱图，点图等等 • geom_boxplot() for box plot• geom_violin() for violin plot• geom_dotplot() for dot plot• geom_jitter() for stripchart• geom_line() ...