github链接:wangweifeng2018/plotCNVHeatmap_genome #Step1. 下载 Bioconductor-copynumber 源码文件, $wget http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/src/contrib/copynumber_1.26.0.tar.gz $tar -zxvf copynumber_1.26.0.tar.gz $cd copynumber/R/ #Step2.修改源码文件 ##修改addChromlines.r文件...
ggplot_tile进行画图 gplots 数据处理成矩阵形式,给行名列名 调制颜色并用heatmap.2画热图(heatmap.2函数内部用hclustfun 进行聚类) R语言代码 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 library(ggplot2)library(data.table)CN_DT<-fread("/home/ywliao/project/Gengyan/ONCOCNV_result/ONC...
gplots 数据处理成矩阵形式,给行名列名 调制颜色并用heatmap.2画热图(heatmap.2函数内部用hclustfun 进行聚类) R语言代码 library(pheatmap)library(data.table)CN_DT<- fread("/home/ywliao/project/Gengyan/ONCOCNV_result/ONCOCNV_all_result.txt",sep="\t")dt<-CN_DT[cfDNATime=="cfDNA1"]wdt<- d...
analyze_CNV圆形图_分布直方图.R analyze_WGCNA.R package_ggplot2.md plot_Admixture.R plot_CMplot_circol_map.r plot_CV.r plot_Hap_pheatmap.r plot_Liu_单倍型ComplexHeatmap.R plot_Manhantan.R plot_Manhattan.py plot_PCA_inLinux.r plot_PCA(含3D) ...
Making the final infercnv heatmap INFO [2021-03-11 04:26:46] ::plot_cnv:Start INFO [2021-03-11 04:26:46] ::plot_cnv:Current data dimensions (r,c)=15034,6903 Total=104935060.812655 Min=0.274614818050265 Max=3.47381304931877. INFO [2021-03-11 04:26:47] ::plot_cnv:Depending on the si...
analyze_CNV圆形图_分布直方图.R analyze_WGCNA.R package_ggplot2.md plot_Admixture.R plot_CMplot_circol_map.r plot_CV.r plot_Hap_pheatmap.r plot_Liu_单倍型ComplexHeatmap.R plot_Manhantan.R plot_Manhattan.py plot_PCA_inLinux.r plot_PCA(含3D) plot_SNP密度条形图 plot_Treemix.R plot_admix...
ggplot_tile进行画图 gplots 数据处理成矩阵形式,给行名列名 调制颜色并用heatmap.2画热图(heatmap.2函数内部用hclustfun 进行聚类) R语言代码 library(pheatmap)library(data.table)CN_DT<- fread("/home/ywliao/project/Gengyan/ONCOCNV_result/ONCOCNV_all_result.txt",sep="\t")dt<-CN_DT[cfDNATime=...
(basic_function_string,heatmap_legends, last_function_string) pdf(file = out_name, height = my_height, width = my_width,family =my_family ) print(whole_function_string) eval(parse(text = whole_function_string)) draw(p) dev.off() }else if(fourth_column==1&fifth_column==0){ two_...
analyze_CNV圆形图_分布直方图.R analyze_WGCNA.R package_ggplot2.md plot_Admixture.R plot_CMplot_circol_map.r plot_CV.r plot_Hap_pheatmap.r plot_Liu_单倍型ComplexHeatmap.R plot_Manhantan.R plot_Manhattan.py plot_PCA_inLinux.r plot_PCA(含3D) plot_SNP密度条形图 plot_Treemix.R plot_admix...
analyze_CNV圆形图_分布直方图.R analyze_WGCNA.R package_ggplot2.md plot_Admixture.R plot_CMplot_circol_map.r plot_CV.r plot_Hap_pheatmap.r plot_Liu_单倍型ComplexHeatmap.R plot_Manhantan.R plot_Manhattan.py plot_PCA_inLinux.r plot_PCA(含3D) plot_SNP密度条形图 plot_Treemix.R plot_admix...