`plot_cell_trajectory`函数包含以下参数: -`data`:表示数据集的变量,包含细胞的状态信息。 -`x`:表示绘制细胞轨迹图的x坐标数据。 -`y`:表示绘制细胞轨迹图的y坐标数据。 -`color`:用于表示细胞状态的颜色数据。 -`size`:细胞状态的大小数据。 -`alpha`:细胞状态的透明度。 -`shape`:根据细胞类型定义的形...
1. 从trajectory图中提取数据 p2$layers[[1]]$data > p2<-plot_cell_trajectory(object_used_monocle2.cds,cell_size=1,color_by="seurat_clusters",show_tree=T)>p2 '#示例一 > head(p2$layers[[1]]$data) source target source_prin_graph_dim_1 source_prin_graph_dim_2 target_prin_graph_dim_...
plot_complex_cell_trajectory.Rd plot_genes_branched_heatmap.Rd plot_genes_branched_pseudotime.Rd plot_genes_in_pseudotime.Rd plot_genes_jitter.Rd plot_genes_positive_cells.Rd plot_genes_violin.Rd plot_multiple_branches_heatmap.Rd plot_multiple_branches_pseudotime.Rd ...