PlantscRNAdb数据库目前涵盖了已开展单细胞研究的4个模式植物(拟南芥、水稻、番茄和玉米),提供了多种来源的细胞类型标记基因信息,如早期实验、RNA-Seq和scRNA-Seq等途径获得的标记基因。 * 目前提供的标记基因中,大多数(> 90%)来自最近的植物scRNA表达差异鉴定。为明确这类标记基因的可信度等级,樊龙江团队重新分析scR...
PlantscRNadb 是一个用于植物单细胞 RNAseq分析的数据库,其中包括15个物种(拟南芥、水稻、番茄、玉米、野草莓、 杨树、烟草、小柠檬、油菜、木薯、苜蓿、荆芥、陆地棉、大豆、白蝴蝶兰),38个组织,451种细胞类型,114770个marker基因。 你是否想要了解植物的微观世界?这个数据库中是否有你正在关注着或研究着的神奇之物...
作者建立了植物scRNA-seq数据库(PlantscRNAdb; http://ibi.zju.edu.cn/plantscrnadb/)。 PlantscRNAdb包含4种植物(拟南芥、水稻、番茄和玉米)的128种不同细胞类型的26326个marker基因,该数据库还可用于探索单个细胞类型和全基因组规模的基因表达。 PlantscRNAdb介绍 Fig 1a-b 作者收集了拟南芥、水稻、番茄和玉米...
听说5月初有一个植物单细胞数据库发布啦! 2021年5月4日,浙江大学樊龙江教授团队在Molecular Plant在线发表了题为“PlantscRNAdb: A Database for Plant Single-cell RNA Analysis”论文,介绍了他们刚刚建立的植物单细胞RNA(scRNA)分析数据库“PlantscRNAdb”。 PlantscRNAdb数据库目前涵盖了已开展单细胞研究的4个模...
PlantscRNAdb数据库目前涵盖了已开展单细胞研究的4个模式植物(拟南芥、水稻、番茄和玉米),提供了多种来源的细胞类型标记基因信息,如早期实验、RNA-Seq和scRNA-Seq等途径获得的标记基因。 * 目前提供的标记基因中,大多数(> 90%)来自最近的植物scRNA表达差异鉴定。为明确这类标记基因的可信度等级,樊龙江团队重新分析scR...