通过转录组分析,总共组装了62215 个单基因,N50为1562 bp,其中62.57%可以被注释。为进一步研究PI3K抑制剂(LY294002)对冷却滩羊肉的影响,采用GO和KEGG富集分析对583 个基因进行了分类。GO分析表明DEGs主要富集于信号转导过程和胞外区。KEGG...
检索信号通路时,我们最常用的数据库就是KEGG数据库。 KEGG数据库是一个综合数据库,它整合了基因组、化学和系统功能信息,并建立了跨物种间的联系。 它基于可计算的形式捕捉和组织实验得到的证据,形成系统的功能知识库,并能通过强大的图形...
通过这一段简要的介绍,你应该发现kegg通路图中的抑制(钝头符号)或促进(箭头符号)在不同情境下对应不同的机制。例如,抑制的功能可能是通过促进靶蛋白降解、阻止靶蛋白与其他蛋白结合,阻止靶蛋白进入细胞核等多种形式实现。我们必须通过查询其他资料才能读懂kegg通路图中促进/抑制图标对应的具体的生物学机制。 基迪奥客户...
即,这个激酶复合物由两个基因构成,且每个亚基成分可以来源不同的同源基因。你可以试试将鼠标移动到PI3K-AKT的KEGG map的PI3K基因上(如下图),在弹出的窗口中可以看到这个分子对应的基因两个K号,每个K号对应三个基因。其中,K00922是催化亚基,对应PI3KCA/B/D三个基因(即可能来源这3个基因中的一个);K02649是调节...
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PI3K-AKT信号通路简介及在kegg通路中的位置 PI3K-AKT途径是一种细胞内信号转导途径,响应细胞外信号,促进代谢、增殖、细胞存活、生长和血管生成。这一过程是通过一系列下游底物的丝氨酸或苏氨酸磷酸化介导的,涉及的关键基因是磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)和AKT/蛋白激酶b,所以这一通路直接用这两个基因命名。
📚 接着上篇的JAK-STAT信号通路,当JAK激活的是PI3K时,就会牵扯到PI3K-AKT信号通路。这个通路的特点是蛋白不会入核。🔍 在KEGG的信号通路图上,PI3K-AKT信号通路的膜受体有很多,但实际上这些膜受体大部分来自别的信号通路。常见的PI3K-AKT信号通路的膜受体是RTK(绿色圈出的部分)。当RTK结合了GF(生长因子)后,...
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PI3K-AKT信号通路详解PI3K-AKT途径是细胞内至关重要的信号传导途径，它通过响应细胞外信号，调控细胞的代谢、增殖和生存等过程，核心成员包括磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)和AKT/蛋白激酶b。在35个核心通路中，PI3K-AKT与14个通路直接相连，显示其在通路网络中的桥梁作用。在KEGG数据库中，与PI3K-AKT相关的通路...
更重要的是,KEGG分析强调了包括关键靶点在内的PI3K/AKT通路的重要性,作为LF发挥抗GU作用的关键途径。分子对接分析证实,LF的关键成分对关键靶点表现出很强的亲和力。此外,实时PCR和蛋白质印迹结果表明,LF可以逆转这些靶点的表达,激活PI3K/AKT通路,并最终减少细胞凋亡。LF对乙醇诱导的胃溃疡具有胃保护作用,其治疗机制...