Π-烷基作用，疏水作用的一种
另外CDOCKER_ENERGY包含了配体分子内能和其与受体的相互作用能,CDOCKER_INTERACTION_ENERGY只包含相互作用能。如果不需要考虑分子间内能的因素,可以直接将-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY做参考数据 Q5 分子对接中的Alkyl、Pi-Alkyl、Carbon Hydrogen Bond、Pi-Sulfur属于哪种类型的非键作用? 在Discovery Studio的Help中可参考...
Pi-Pi堆叠相互作用是按照[McGaughey, et al., 1998]的方法确定的。 Alkyl Hydrophobic:烷基被定义为以下非极化、非π系:主要是脂肪族氨基酸侧链:包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、蛋氨酸、硒氨酸、半胱氨酸、脯氨酸,赖氨酸的CB、CG和CD原子,精氨酸的CB和CG原子。配体上的疏水基是一组相邻的原子,它们与电荷...
Mixed Pi/Alkyl Hvdrophobic: 相与作用(有时称为CH-T相互用)是氧和环系统之间的弱相互作用。Pi-烷基...
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