做孟德尔phenoscanner不能用怎么办?有替代网站医豌豆科研 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多5974 3 8:21 App 孟德尔随机化课程---如何导入本地数据 5741 -- 3:44 App 无脑操作!41种炎性因子!孟德尔随机化数据 1.3万 5 4:10 App 孟德尔随机化VCF文件读取 1501 -- 19:07 App 高效快捷转...
之前我们去混杂因素使用Phenoscanner,将我们筛选得到的工具变量以rsid的形式输入到网站中,之后网站给出我们SNP相关的性状,我们去判断这些性状是否为混杂因素,如果是混杂因素,我们便认为SNP与混杂因素相关,在后续的MR分析中将其去掉。但是最近Phenoscanner似乎是服务器端有问题了。我们在这里介绍几种其它的去混杂方法。 IEU...
快速搜索,支持大量的rs号查询等功能,无需翻墙搭梯子,所有人均可免费使用!解决查找当前Phenoscanner不能使用的巨大痛点!医工科研-孟德尔HZ 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多407 -- 8:06 App 惊呆!!ChatGPT、Claude无限免费使用,不翻墙 30 -- 1:40 App MendleR代码包,医工科研团队的杰作!保留关键...
Phenoscanner网站崩溃,如何去除混杂? #医工科研云上GWAS #医工科研kim老师 #论文辅导 @抖音小助手 @抖音创作者中心 - 孟德尔随机化课程客服于20240409发布在抖音,已经收获了246个喜欢,来抖音,记录美好生活!
②独立性假设:SNP与混杂因素之间是独立的。 ③排他性假设:SNP只能通过暴露因素对结局产生 作用 其中去除混杂因素是为了满足独立性假设的要求,需要将与混杂因素相关的一些工具变量删除,通过 phenoscanner网站可以搜索工具变量与 表型之问的关系,然后去处与混杂因素有关的工具变量。
Summary:PhenoScanner is a curated database of publicly available results from large-scale genetic association studies. This tool aims to facilitate ‘phenome scans’, the cross-referencing of genetic variants with many phenotypes, to help aid understanding of disease pathways and biology. The database...
phenoscanner allows users to query the PhenoScanner database of genotype-phenotype associations from inside R - phenoscanner/phenoscanner
Databasesandontologies PhenoScanner:adatabaseofhuman genotype–phenotypeassociations JamesR.Staley 1, *,JamesBlackshaw 1 ,MihirA.Kamat 1 ,SteveEllis 1 , PraveenSurendran 1 ,BenjaminB.Sun 1 ,DirkS.Paul 1 ,DanielFreitag 1 , StephenBurgess 1 ,JohnDanesh 1,2,3 ,RobinYoung 1,4,† and AdamS.Bu...
去除孟德尔随机化混杂因素方法1-使用LDtrait工具 Phenoscanner网站崩溃,如何去除混杂? 我们都知道孟德尔随机化三大假设:①关联性假设: SNP与暴露因素之间是强相关的。②独立性假设: SNP与混杂因素之间是独立的。 - 孟德尔随机化课程客服于20240313发布在抖音,已经收
06去除混杂因素(PhenoScanner) 摘要:比如说我们做体重指数和肺癌的孟德尔随机化分析,因为吸烟,它跟肺癌是相关的,那么吸烟就可以作为这个分析的一个混杂因素,我们在寻找工具变量的时候,如果我们找到的工具变量跟吸烟是相关的话,我们就可以把这些SNP把它删掉,因为这些工具变量它可能通过吸烟去影响肺癌,而不是通过我们研究...