在R语言中,pheatmap包是一个用于绘制热图的强大工具。下面是对pheatmap包的详细介绍: 一、pheatmap包的作用和用途pheatmap包主要用于绘制层次聚类热图,它可以帮助用户直观地展示数据矩阵中不同样本或变量之间的相似性和差异性。通过颜色的深浅变化,用户可以轻松地识别出数据中的模式和趋势。在生物学、医学、统计学等领域...
这是之前的代码 library(pheatmap)choose_gene=head(rownames(nrDEG),25)choose_matrix=exprSet[choose_gene,]choose_matrix=t(scale(t(choose_matrix)))pheatmap(choose_matrix)下面是新代码 library(pheatmap)#加载R包 annotation_col = data.frame(group_list)rownames(annotation_col)=colnames(exprSet)colnames...
这是之前的代码 library(pheatmap) choose_gene=head(rownames(nrDEG),25) choose_matrix=exprSet[choose_gene,] choose_matrix=t(scale(t(choose_matrix))) pheatmap(choose_matrix) 下面是新代码 library(pheatmap)#加载R包 annotation_col = data.frame(group_list) rownames(annotation_col)=colnames(exprSet...
8934 3 07:26 App R语言pheatmap包做热图的时候如何修改字体为新罗马字体 3396 0 10:44 App R语言ggplot2作图给文本设置斜体、黑体、上下标等 6.4万 43 06:00 App 5分钟掌握使用R语言绘制热图的实用教程 1148 0 12:11 App pheatmap的临床热图 2399 0 07:22 App R语言ggplot2做热图的时候如何在色块上添加...
少废话,直接上代码 软件平台:R(3.4.3)library(pheatmap)library(RColorBrewer)library(ggsci)library(DESeq2)vsd.T <- vst(dds, blind = FALSE) 选取差异基因做热图 resSig_P <- subset(res, abs(log2FoldChange)>1 & padj < 0.01)mat.1 <- assay(vsd.T.1[rownames(resSig_P), ])mat.1 <- ...
pheatmap是一个用于绘制热图的R语言包,它可以用于可视化矩阵数据。在热图中添加黑色或边框线的间隙,可以通过调整pheatmap函数的参数来实现。 要在热图中添加黑色间隙,可以使用参数borde...
pheatmap包的用法 pheatmap是一个R语言的包,用于创建矩阵的热图。它可以按照设定的颜色映射将矩阵的值可视化为热图,以便于观察数据的模式和关系。 pheatmap函数的一般用法如下: ```R pheatmap(mat, ...) ``` 参数说明: - mat:要可视化的矩阵或数据框。 - ...:可选的参数,用于控制热图的样式和其他属性。
R语言——pheatmap包 载入包 library(pheatmap) 载入数据 data_frame = read.csv("file_path.csv", header = T, #将第行设为列名 ) # 将第一列设为行名 rownames(data_frame) = data_frame[,1] data_frame = data_frame[,-1] #删除第一列 绘制热图 pheatmap(data, scale="row", #对行进行...
代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 load("abc.Rdata") 作图代码 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 pheatmap(dat01,annotation_row=NULL,annotation_names_row=T,labels_row=rownames(dat01),legend=T,show_rownames=T,cluster_rows=clusterFeatures,cluster_cols=clusterPhenos...
跟着Nature学作图:R语言pheatmap包做热图并添加文本标注 6154 1 10:31 App R语言tidyverse包做数据处理的实例~批量读取数据,过滤、排序、去重 5.7万 19 05:35 App R语言如何读取excel的数据 6.4万 43 06:00 App 5分钟掌握使用R语言绘制热图的实用教程 7906 10 15:11 App R语言ggplot2作图的时候如何更改字...