作为一款专注于完整糖肽水平上糖蛋白质组定量的工具,pGlycoQuant兼容了多种搜索引擎的鉴定结果,支持多种定量策略。在广泛适用的同时,大幅度减少了大规模糖蛋白质组数据的定量缺失值,提高了定量准确性。pGlycoQuant为差异位点特异性糖基化蛋白质组学研究提供了高效定量工具,期待其能够助力糖基化相关诊疗标志物研究。...
在这里,作者报道了pGlycoQuant,一种用于初级和串联质谱的完整糖肽定量的通用工具。pGlycoQuant的进步之处在于:使用了一个深度学习模型来降低了19-89%的缺失值,相较于Byologic, MSFragger-Glyco, Skyline, Proteome Discoverer, 和 a Match In Run algorithm,可以覆盖更多的糖肽。而这极大地扩展了几个广泛使用的搜索...
2022年12月7日,复旦大学生物医学研究院曹纬倩团队与北京航空航天大学医学科学与工程学院刘超团队在Nature Communications在线发表了题为“pGlycoQuant with a deep residual network for quantitative glycoproteomics at intact glycopeptide level”的研...
Fig. 2: Evaluation of pGlycoQuant performance on intact glycopeptide quantitation of label-free data. Full size image The low quantitative reproducibility and consistency is often manifested as data missing values. We defined two indicators, the proportion of missing values in line (PMVL) and the ...
网站名称 网站负责人 网站首页网址 www.pglycoquant.com 域名过期时间 2027年07月21日 Whois查询 是否接入阿里 已接入 查询 是否接入腾讯 未接入 查询 安全认证 快捷查询 Whois查询 IP查询 SEO综合查询 网站测速 可备案后缀 企业工商信息 查看全部 暂无数据 数据来源: 星网 该单位已备案域名 查看全部 16...
pGlycoQuant enables intact glycopeptide quantitation with very low missing values via a deep residual network, thus greatly expanding the quantitative function of several powerful search engines, currently including pGlyco 2.0, pGlyco3, Byonic and MSFragger-Glyco. The pGlycoQuant-based site-specific N-...
First of all, we evaluated the quantitative accuracy of pGlycoQuant with MBR analysis through two dedicated experimental designs, a two-glycoproteome experiment and a fold change-(de)glycoproteome experiment. In the two-glycoproteome experiment, we performed intact glycopeptide quantitation with MBR in...