Example 11: 变异(SNPs, Indels)检测与注释,并构建基于参考基因组的SNPs进化树。 $pgcgap --VAR --threads 4 --refgbk /mnt/h/PGCGAP_Examples/Reads/MG1655.gbff --ReadsPath Reads/Illumina --reads1 _1.fastq.gz --reads2 _2.fastq.gz --suffix_len 11 --strain_num 6 --qualtype sanger --Pan...