PGCGAP是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道,该管道包含12个模块,可以接受Illumina双端reads、Oxford reads或PacBio reads作为输入,可以完成基因组组装、基因预测和注释,并可以进行比较基因组学分析,包括构建单拷贝核心蛋白进化树以及单拷贝核心基因SNPs进化树,基于Multi-FASTA序列构建进化树,泛基因组分析,全基因...