一、pfam数据库的基本概念 pfam数据库是一个蛋白质家族数据库,它包含了大量的蛋白质家族信息。这些信息是通过比较和分析已知的蛋白质序列而得出的。通过将具有相似序列特性的蛋白质归为一个家族,pfam数据库为研究人员提供了方便的工具来研究蛋白质的功能和结构。 二、pfam数据库的特点 丰富的数据资源:pfam数据库包含...
我看到很多文章里提到预测序列信号肽和基序需要用Pfam，网上能找到网页，但我不会用，请会使用的同学帮...
其实就是该物种的所有蛋白质对应的Pfam的集合。 该数据库最新版本为31.0, 于2017年3月更新,包含16712个蛋白质家族信息。ftp地址如下 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/Pfam31.0/ 后缀为hmm的文件是由HMMER3构建的隐马可夫模型,可用于序列比对。
商标名称 PFAM 国际分类 第09类-科学仪器 商标状态 商标注册申请 申请/注册号 27162465 申请日期 2017-10-30 申请人名称(中文) 武汉盛世农图智能科技有限公司 申请人名称(英文) - 申请人地址(中文) 湖北省武汉市江岸区后湖街金桥大道18号新地盛世东方8栋3层1室 申请人地址(英文) - 初审公告期号 - 初审公告...
pfam-pfa行业百科 PFAM(Protein Family Analysis and Modeling,蛋白质家族分析与建模)是一种生物信息学技术,用于研究蛋白质家族的结构、功能和相互作用。 具体来说,PFAM通过比对已知的蛋白质序列数据库,寻找具有相似结构和功能的蛋白质家族,并利用计算机模拟和实验验证来揭示其生物学功能和相互作用网络。PFAM可以应用于...
Protein topology for each relevant Pfam family (in parenthesis the PDBid of the corresponding protein) and protein fold.Lucas A., DefelipeEsteban, LanzarottiDiego, GautoMarcelo A., MartíAdrián, G. Turjanski
我也刚接触结构域，想知道用pfam分析后的entry结果该怎么分析呢？发自小木虫IOS客户端 ...
摘要 本发明公开了一种机械装置PFAM结构化分解方法;其包括以下步骤:建立零件谱、工况谱、载荷谱、功能谱和故障谱;确定分谱元素功能,建立功能矩阵,实现谱系‑功能映射;确定功能与动作对应关系,实现功能‑动作映射;确定动作对应微元,实现动作‑微元映射。本发明解决了结构复杂、工况多变、载荷多变、故障模式繁多的...
Pfam is a large collection of protein domains and families. Its scientific goal is to provide a complete and accurate classification of protein families and domains. The next release of the database will contain over 10,000 entries, which leads us to reflect on how far we are from completing...
Pfam contains multiple alignments and hidden Markov model based profiles (HMM-profiles) of complete protein domains. The definition of domain boundaries, family members and alignment is done semi-automatically based on expert knowledge, sequence similarity, other protein family databases and the ability ...