本地分析 数据下载 因为是在服务器上直接操作下载,如果自己的电脑可以自行配置系统,然后进行数据库下载。 Pfam-A为高质量,手工确定的蛋白结构域数据,Pfam-B为基于Pfam-A数据库自动注释得到的蛋白结构域数据库,我们这里只下载了Pfam-A即可。 wget ftp://ftp.ebi.ac.uk:21/pub/databases/Pfam/curren
SEQ 3. pfam数据库的注释及本地分析 (pfam_scan), 视频播放量 309、弹幕量 0、点赞数 8、投硬币枚数 0、收藏人数 12、转发人数 3, 视频作者 桓峰基因, 作者简介 ,相关视频:SEQ 10. 预测真核生物蛋白质的亚细胞定位(DeepLoc),SEQ 9. α-螺旋和 β-桶跨膜蛋白的预测(DeepTM
http://eggnog-mapper.embl.de/ 这个也可以配置本地版,数据比较多的话还是配置本地版比较方便,但是这个软件的本地版需要对应的数据库,在国内网络不太好的话下载数据库文件还挺费劲的 注释完拿到的数据格式 统计一下每个基因ID属于哪个类别 就是 核心 可变这些 read_tsv("cell.soybean.PanGenome/Orthogroups.tsv...
5转录组数据分析，差异基因的功能在GO和其他数据库（NR, Swiss_port, Pfam）上有注释，但是KEGG上却没...