Pfam数据库是一个重要的资源,用于研究蛋白质的结构和功能。它收集了大量使用多重序列比对和隐马尔可夫模型(HMMs)对UniProKB的蛋白质序列数据进行结构域归类形成的蛋白质家族。Pfam数据库的主要用途包括: 结构域归类:通过序列比对推测蛋白质的结构域排布形式及功能,帮助研究人员理解蛋白质的结构和...
其实就是该物种的所有蛋白质对应的Pfam的集合。 该数据库最新版本为31.0, 于2017年3月更新,包含16712个蛋白质家族信息。ftp地址如下 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/Pfam31.0/ 后缀为hmm的文件是由HMMER3构建的隐马可夫模型,可用于序列比对。 关于“Pfam数据库有什么用”这篇文章就分享到这里...
可能就是你这个gene没有对应的信息而已。如果不肯定结果你可以自己去kegg数据库进行注释试试。
其实就是该物种的所有蛋白质对应的Pfam的集合。 该数据库最新版本为31.0, 于2017年3月更新,包含16712个蛋白质家族信息。ftp地址如下 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/Pfam31.0/ 后缀为hmm的文件是由HMMER3构建的隐马可夫模型,可用于序列比对。 关于“Pfam数据库有什么用”这篇文章就分享到这里...