Perl模块一开始没想着用conda安装,因为很少有模块能直接安装。但既然bioperl是个庞然大物,何不查看试下。果然是可以的: conda install-c bioconda perl-bioperl 安装成功。此时仍不能用bioperl,需要加入环境变量。怎么找到安装路径是个技术活。 $ find anaconda3/*-name"Seq.pm"anaconda3/envs/repeat/lib/perl5...
1、bioperl安装(无需root权限)https://www.jianshu.com/p/f348464c52da(后面执行build不存在,这个失败) 2、https://metacpan.org/release/BioPerl(根据官网安装提示直接安装,时间较长,中间需要y) 3、https://npm.taobao.org/package/node-tool-utils(使用npm安装的提示)...
001、 检索该模块:https://metacpan.org/ 002、下载该模块 003、解压、安装 tar -xzvf BioPerl-1.7.8.tar.gz cd BioPerl-1.7.8/perl Makefile.PL make make install 004、测试安装效果 (base) [root@pc1 BioPerl-1.7.8]#perldoc BioPerl |headNAME BioPerl- Perl modulesforbiology VERSION version1.7...
BioPerl是基于Perl语言的生物信息学工具包,因此首先需要确保你的Windows系统上已经安装了Perl解释器。如果没有安装,可以从Perl官网下载并安装适用于Windows的Perl版本。 2. 访问BioPerl官方网站或资源页面获取安装说明 BioPerl的官方网站提供了详细的安装说明。你可以访问BioPerl官网或相关资源页面来获取最新的安装指南。 3...
install Bio::Seq 1. 2. 因为没用国内的镜像,可能比cpanm还要更长时间,等来的确是Error,一些依赖照样装不上。 成功尝试:直接conda安装bioperl Perl模块一开始没想着用conda安装,因为很少有模块能直接安装。但既然bioperl是个庞然大物,何不查看试下。果然是可以的: ...
cpaninstallBio::Seq 因为没用国内的镜像,可能比cpanm还要更长时间,等来的确是Error,一些依赖照样装不上。 成功尝试:直接conda安装bioperl Perl模块一开始没想着用conda安装,因为很少有模块能直接安装。但既然bioperl是个庞然大物,何不查看试下。果然是可以的: ...
linux下perl及bioperl安装 perl安装 下载地址:http://www.perl.org/get.html 安装: tar zxvf perl-5.26.1.tar.gzcdperl-5.26.1/ ./Configure –de -Dprefix=/opt/perl5#目的安装目录make maketestmake install AI代码助手复制代码 测试: perl –v ...
网上有这样的几种安装方法: 1.sudo apt-get install bioperl (ubuntu里貌似有源) 2用CPAN perl -MCPAN -e shell cpan>d /bioperl/ cpan>install S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz (选择其中的一个) 或者是cpan>force install S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz(force强制安装,不会报错) ...
Bioperl是一个用于生物信息学的Perl工具包,它提供了大量的模块来处理生物学数据,如序列分析、基因组学、蛋白质结构等。 安装步骤 1. 安装依赖 首先,确保系统上安装了所有必要的依赖项。可以使用以下命令安装一些常见的依赖: 代码语言:txt 复制 sudo apt-get update sudo apt-get install -y build-essential cpanm...
Bioperl安装 安装conda install -c bioconda perl-bioperl 安装完成如果不能正常调用bioperl出现Can‘t locate Bio/Perl.pmin @INC等报错,则需要配置一下@INC。 配置方法首先找到Perl.pm装在哪里 find ./ -name "Perl.pm" ./miniconda3/lib/perl5/site_perl/5.22.0/Bio/Perl.pm...