看GC分布图没问题,前面几个碱基抖动正常的;
这可能会导致数据不准确,影响实验结果。此外,处理具有高错误率的测序数据会消耗更多的时间和资源,导致需要重新测序,浪费实验宝贵的资源。因此,分析每个碱基的质量是确保测序数据可靠性的重要步骤。 最后,如何对“per base sequence quality”进行分析呢?测序数据的质量评估可以使用多种工具,包括FastQC和Trimmomatic等。
一般要求所有位置的10%分位数大于20,即大于最多允许该位置10%的序列低于Q20。当任何碱基质量低于10,或者任何中位数低于25报WARN,需注意;当任何碱基质量低于5或者任何中位数低于20报FAIL。 参考来源: https://blog.csdn.net/gateswell/article/details/78858579...