Prodar是一个搜索应用程序,可查询PDB以获取候选结构比对。 搜索的输入是从标准(文本)PDB文件中读取的蛋白质骨架结构,返回的结果仅基于骨架的结构相似性,而与序列信息无关。 搜索速度非常快,通常不到一分钟即可搜索到PDB(包含在应用程序中)。 Prodar会识别部分匹配项,因此无论链的相对大小如何,查询结构的较小部分都...