PDBbind核心集的编译旨在提供一组相对较小的、高质量的蛋白质-配体复合物,用于验证对接/评分方法。特别是,该数据集已成为我们小组开发的流行的比较评估评分函数(CASF)基准的主要测试集。PDBbind核心集不再包含在PDBbind数据包中,因为它不像PDBbind本身那样每年更新一次。研究人员可以通过在http://www.pdbbind-cn.or...
PDBbind核心集不包含在PDBbind数据包中,因为它不会像PDBbind本身那样每年更新。用户可以通过在pdbbind.org.cn/casf.php下载CASF数据包获取PDBbind核心集。最新版本的PDBbind核心集包含在CASF-2016中,由285个蛋白质-配体复合物组成。PDBbind数据库中的每个复合物的基本信息是完全公开的(请参见[BROWSE...
PDBbind数据库计算机辅助药物设计本文首先回顾了e-Science的产生背景与内涵,分析了信息化技术在现代计算机辅助药物设计中的重要作用与意义.然后介绍本课题组科研工作的主要内容与框架,以PDBbind数据库的构建和开发为案例,阐明本课题组的信息化应用架构,介绍了一些基于PDBbind数据库开发的软件方法以及研究实例.最后对e-...