PDB(Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 这里整理网上已有的一些资料, 对PDB格式做个简短介绍. 对大多数用户而言, 了解这些内容就够了, 但对那些需要创建PDB...
PDB(Protein Data Bank,简称PDB)蛋白质结构数据库是美国Brookhaven国家实验在1971年创建,由结构生物信息学研究合作组织(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics,简称RCSB)维护。和核酸序列数据库…
PDB数据库,全称为蛋白质数据银行(Protein Data Bank),是一个记录了所有已经解析出三维结构的生物大分子蛋白质和核酸的数据库。它的主要作用可以归纳为以下几点:一、提供生物大分子的三维结构信息;二、推动生物学和医学研究的发展;三、辅助药物设计和研发;四、服务于生物信息学和系统生物学研究。 以“推动生物学和医...
PDB(Protein Data Bank)数据库是由X射线晶体学、NMR光谱学和冷冻电镜技术实验获得的蛋白质三维结构数据。其中,X射线晶体学是主要的蛋白质结构解析手段,能够得到原子级别的蛋白质结构数据;NMR光谱学主要用于小分子蛋白的结构解析,能获取到蛋白质在溶液中的动态结构信息;冷冻电镜技术是近年来发展起来的新型结构生物学手段...
蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,网址是http://www.rcsb.org。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果...
PDB蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,PDB)(rcsb.org/)是美国Brookhaven国家实验室于1971年创建的,由结构生物信息学研究合作组织(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics,RCSB)维护。PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍...
蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多,其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD,详见Uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有PDB(Protein Data Bank,简称PDB,开始建立于1971年)等。国内也有些如由上海生物信息技术研究...
蛋白质结构数据库(ProreinData Bank,PDB)是1971年创建的国际上最著名、最完整的蛋白质三维结构数据库。另外还有蛋白质分类数据库SCOP和CATH。SCOP是英国医学研究委员会分子生物学实验室和蛋白质工程中心开发的基于Web的蛋白质结构分类、检索和分析系统。CATH是另一个著名的蛋白质分类数据库,由英国伦敦大学开发和维护。
蛋白质数据库Protein DataBank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,网址是http://www.rcsb.org。PDB可以经由网络免费访问, 是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。PDB数据库存储结构数 ...